Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CHMP4BP1P59074 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHMP4BP1P59074 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CHMP4BP1P59074 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHMP4BP1P59074 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHMP4BP1P59074 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHMP4BP1P59074 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHMP4BP1P59074 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHMP4BP1P59074 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHMP4BP1P59074 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHMP4BP1P59074 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHMP4BP1P59074 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHMP4BP1P59074 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHMP4BP1P59074 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHMP4BP1P59074 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHMP4BP1P59074 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHMP4BP1P59074 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHMP4BP1P59074 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHMP4BP1P59074 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHMP4BP1P59074 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CHMP4BP1P59074 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CHMP4BP1P59074 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CHMP4BP1P59074 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CHMP4BP1P59074 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHMP4BP1P59074 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHMP4BP1P59074 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHMP4BP1P59074 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHMP4BP1P59074 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHMP4BP1P59074 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHMP4BP1P59074 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHMP4BP1P59074 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHMP4BP1P59074 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHMP4BP1P59074 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHMP4BP1P59074 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHMP4BP1P59074 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHMP4BP1P59074 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHMP4BP1P59074 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHMP4BP1P59074 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHMP4BP1P59074 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHMP4BP1P59074 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHMP4BP1P59074 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CHMP4BP1P59074 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHMP4BP1P59074 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHMP4BP1P59074 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHMP4BP1P59074 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CHMP4BP1P59074 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHMP4BP1P59074 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CHMP4BP1P59074 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHMP4BP1P59074 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHMP4BP1P59074 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHMP4BP1P59074 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHMP4BP1P59074 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHMP4BP1P59074 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHMP4BP1P59074 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHMP4BP1P59074 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHMP4BP1P59074 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHMP4BP1P59074 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHMP4BP1P59074 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHMP4BP1P59074 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHMP4BP1P59074 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHMP4BP1P59074 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHMP4BP1P59074 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHMP4BP1P59074 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHMP4BP1P59074 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHMP4BP1P59074 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHMP4BP1P59074 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHMP4BP1P59074 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHMP4BP1P59074 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CHMP4BP1P59074 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHMP4BP1P59074 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHMP4BP1P59074 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHMP4BP1P59074 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHMP4BP1P59074 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHMP4BP1P59074 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CHMP4BP1P59074 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHMP4BP1P59074 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHMP4BP1P59074 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CHMP4BP1P59074 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHMP4BP1P59074 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHMP4BP1P59074 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHMP4BP1P59074 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHMP4BP1P59074 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CHMP4BP1P59074 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHMP4BP1P59074 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHMP4BP1P59074 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHMP4BP1P59074 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHMP4BP1P59074 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CHMP4BP1P59074 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHMP4BP1P59074 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHMP4BP1P59074 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHMP4BP1P59074 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHMP4BP1P59074 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHMP4BP1P59074 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHMP4BP1P59074 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHMP4BP1P59074 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CHMP4BP1P59074 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHMP4BP1P59074 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHMP4BP1P59074 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHMP4BP1P59074 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHMP4BP1P59074 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms