Protein–RNA interactions for Protein: P54849

EMP1, Epithelial membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP1P54849 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EMP1P54849 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EMP1P54849 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EMP1P54849 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EMP1P54849 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EMP1P54849 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EMP1P54849 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EMP1P54849 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EMP1P54849 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EMP1P54849 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EMP1P54849 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EMP1P54849 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EMP1P54849 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EMP1P54849 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EMP1P54849 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EMP1P54849 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EMP1P54849 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EMP1P54849 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
EMP1P54849 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EMP1P54849 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EMP1P54849 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EMP1P54849 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EMP1P54849 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EMP1P54849 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EMP1P54849 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EMP1P54849 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
EMP1P54849 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EMP1P54849 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EMP1P54849 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EMP1P54849 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EMP1P54849 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMP1P54849 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMP1P54849 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMP1P54849 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMP1P54849 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMP1P54849 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMP1P54849 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMP1P54849 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
EMP1P54849 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EMP1P54849 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EMP1P54849 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
EMP1P54849 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EMP1P54849 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EMP1P54849 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EMP1P54849 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EMP1P54849 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EMP1P54849 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EMP1P54849 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EMP1P54849 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EMP1P54849 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EMP1P54849 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EMP1P54849 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EMP1P54849 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
EMP1P54849 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EMP1P54849 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EMP1P54849 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EMP1P54849 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EMP1P54849 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EMP1P54849 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EMP1P54849 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EMP1P54849 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EMP1P54849 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EMP1P54849 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EMP1P54849 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EMP1P54849 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EMP1P54849 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EMP1P54849 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EMP1P54849 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
EMP1P54849 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EMP1P54849 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EMP1P54849 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EMP1P54849 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EMP1P54849 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EMP1P54849 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EMP1P54849 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EMP1P54849 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EMP1P54849 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EMP1P54849 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EMP1P54849 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EMP1P54849 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
EMP1P54849 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
EMP1P54849 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EMP1P54849 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
EMP1P54849 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EMP1P54849 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EMP1P54849 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EMP1P54849 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EMP1P54849 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EMP1P54849 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EMP1P54849 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
EMP1P54849 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EMP1P54849 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EMP1P54849 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EMP1P54849 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EMP1P54849 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EMP1P54849 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EMP1P54849 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EMP1P54849 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EMP1P54849 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EMP1P54849 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms