Protein–RNA interactions for Protein: P54105

CLNS1A, Methylosome subunit pICln, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNS1AP54105 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLNS1AP54105 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CLNS1AP54105 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLNS1AP54105 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLNS1AP54105 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLNS1AP54105 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLNS1AP54105 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLNS1AP54105 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLNS1AP54105 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLNS1AP54105 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CLNS1AP54105 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLNS1AP54105 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLNS1AP54105 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLNS1AP54105 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLNS1AP54105 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLNS1AP54105 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLNS1AP54105 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLNS1AP54105 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLNS1AP54105 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLNS1AP54105 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLNS1AP54105 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLNS1AP54105 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLNS1AP54105 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CLNS1AP54105 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CLNS1AP54105 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLNS1AP54105 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLNS1AP54105 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CLNS1AP54105 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CLNS1AP54105 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLNS1AP54105 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLNS1AP54105 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLNS1AP54105 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLNS1AP54105 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLNS1AP54105 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLNS1AP54105 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLNS1AP54105 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLNS1AP54105 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLNS1AP54105 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLNS1AP54105 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLNS1AP54105 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLNS1AP54105 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLNS1AP54105 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLNS1AP54105 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLNS1AP54105 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLNS1AP54105 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLNS1AP54105 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CLNS1AP54105 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CLNS1AP54105 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLNS1AP54105 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLNS1AP54105 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLNS1AP54105 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLNS1AP54105 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLNS1AP54105 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLNS1AP54105 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLNS1AP54105 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLNS1AP54105 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLNS1AP54105 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLNS1AP54105 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLNS1AP54105 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CLNS1AP54105 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLNS1AP54105 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLNS1AP54105 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLNS1AP54105 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLNS1AP54105 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLNS1AP54105 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLNS1AP54105 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLNS1AP54105 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLNS1AP54105 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLNS1AP54105 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLNS1AP54105 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CLNS1AP54105 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLNS1AP54105 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLNS1AP54105 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLNS1AP54105 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CLNS1AP54105 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLNS1AP54105 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CLNS1AP54105 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLNS1AP54105 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CLNS1AP54105 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLNS1AP54105 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CLNS1AP54105 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLNS1AP54105 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLNS1AP54105 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLNS1AP54105 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLNS1AP54105 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLNS1AP54105 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLNS1AP54105 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLNS1AP54105 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLNS1AP54105 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLNS1AP54105 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLNS1AP54105 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLNS1AP54105 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLNS1AP54105 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLNS1AP54105 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLNS1AP54105 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLNS1AP54105 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLNS1AP54105 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CLNS1AP54105 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLNS1AP54105 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLNS1AP54105 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms