Protein–RNA interactions for Protein: P53985

SLC16A1, Monocarboxylate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC16A1P53985 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC16A1P53985 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC16A1P53985 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC16A1P53985 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC16A1P53985 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC16A1P53985 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC16A1P53985 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC16A1P53985 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC16A1P53985 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC16A1P53985 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC16A1P53985 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC16A1P53985 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC16A1P53985 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC16A1P53985 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC16A1P53985 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC16A1P53985 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC16A1P53985 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC16A1P53985 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC16A1P53985 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC16A1P53985 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC16A1P53985 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC16A1P53985 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC16A1P53985 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC16A1P53985 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC16A1P53985 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC16A1P53985 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC16A1P53985 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC16A1P53985 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC16A1P53985 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC16A1P53985 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC16A1P53985 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC16A1P53985 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC16A1P53985 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC16A1P53985 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC16A1P53985 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC16A1P53985 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC16A1P53985 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC16A1P53985 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC16A1P53985 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC16A1P53985 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC16A1P53985 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC16A1P53985 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC16A1P53985 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC16A1P53985 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC16A1P53985 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC16A1P53985 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC16A1P53985 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC16A1P53985 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC16A1P53985 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC16A1P53985 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC16A1P53985 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC16A1P53985 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC16A1P53985 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC16A1P53985 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC16A1P53985 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC16A1P53985 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC16A1P53985 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC16A1P53985 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC16A1P53985 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC16A1P53985 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC16A1P53985 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC16A1P53985 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC16A1P53985 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC16A1P53985 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC16A1P53985 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC16A1P53985 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC16A1P53985 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC16A1P53985 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC16A1P53985 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC16A1P53985 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC16A1P53985 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC16A1P53985 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC16A1P53985 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC16A1P53985 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC16A1P53985 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC16A1P53985 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC16A1P53985 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC16A1P53985 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC16A1P53985 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC16A1P53985 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC16A1P53985 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC16A1P53985 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC16A1P53985 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC16A1P53985 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC16A1P53985 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC16A1P53985 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC16A1P53985 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC16A1P53985 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC16A1P53985 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC16A1P53985 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC16A1P53985 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC16A1P53985 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC16A1P53985 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC16A1P53985 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC16A1P53985 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC16A1P53985 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC16A1P53985 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC16A1P53985 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC16A1P53985 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC16A1P53985 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms