Protein–RNA interactions for Protein: P52926

HMGA2, High mobility group protein HMGI-C, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGA2P52926 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGA2P52926 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGA2P52926 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGA2P52926 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGA2P52926 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGA2P52926 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGA2P52926 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGA2P52926 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGA2P52926 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGA2P52926 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGA2P52926 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGA2P52926 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGA2P52926 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGA2P52926 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGA2P52926 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGA2P52926 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGA2P52926 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGA2P52926 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGA2P52926 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGA2P52926 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGA2P52926 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGA2P52926 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGA2P52926 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGA2P52926 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGA2P52926 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGA2P52926 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGA2P52926 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGA2P52926 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGA2P52926 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGA2P52926 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGA2P52926 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGA2P52926 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGA2P52926 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGA2P52926 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGA2P52926 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGA2P52926 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGA2P52926 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGA2P52926 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGA2P52926 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGA2P52926 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGA2P52926 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
HMGA2P52926 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HMGA2P52926 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMGA2P52926 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGA2P52926 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGA2P52926 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGA2P52926 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGA2P52926 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGA2P52926 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGA2P52926 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGA2P52926 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMGA2P52926 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMGA2P52926 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMGA2P52926 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMGA2P52926 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMGA2P52926 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMGA2P52926 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMGA2P52926 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMGA2P52926 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMGA2P52926 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMGA2P52926 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMGA2P52926 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMGA2P52926 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HMGA2P52926 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMGA2P52926 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMGA2P52926 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMGA2P52926 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGA2P52926 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGA2P52926 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGA2P52926 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGA2P52926 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGA2P52926 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGA2P52926 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGA2P52926 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGA2P52926 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGA2P52926 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGA2P52926 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGA2P52926 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGA2P52926 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGA2P52926 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGA2P52926 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMGA2P52926 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMGA2P52926 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMGA2P52926 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HMGA2P52926 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HMGA2P52926 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HMGA2P52926 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGA2P52926 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGA2P52926 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGA2P52926 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGA2P52926 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGA2P52926 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGA2P52926 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGA2P52926 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGA2P52926 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMGA2P52926 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMGA2P52926 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMGA2P52926 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMGA2P52926 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMGA2P52926 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.6 ms