Protein–RNA interactions for Protein: P51809

VAMP7, Vesicle-associated membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP7P51809 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VAMP7P51809 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VAMP7P51809 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VAMP7P51809 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VAMP7P51809 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VAMP7P51809 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VAMP7P51809 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VAMP7P51809 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VAMP7P51809 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VAMP7P51809 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VAMP7P51809 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VAMP7P51809 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VAMP7P51809 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VAMP7P51809 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
VAMP7P51809 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
VAMP7P51809 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VAMP7P51809 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VAMP7P51809 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VAMP7P51809 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VAMP7P51809 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VAMP7P51809 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
VAMP7P51809 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VAMP7P51809 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VAMP7P51809 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VAMP7P51809 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VAMP7P51809 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VAMP7P51809 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VAMP7P51809 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VAMP7P51809 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VAMP7P51809 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VAMP7P51809 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VAMP7P51809 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VAMP7P51809 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
VAMP7P51809 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VAMP7P51809 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VAMP7P51809 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
VAMP7P51809 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VAMP7P51809 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VAMP7P51809 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VAMP7P51809 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VAMP7P51809 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VAMP7P51809 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VAMP7P51809 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
VAMP7P51809 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
VAMP7P51809 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
VAMP7P51809 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
VAMP7P51809 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
VAMP7P51809 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
VAMP7P51809 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
VAMP7P51809 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VAMP7P51809 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VAMP7P51809 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
VAMP7P51809 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VAMP7P51809 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
VAMP7P51809 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VAMP7P51809 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VAMP7P51809 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VAMP7P51809 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
VAMP7P51809 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
VAMP7P51809 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VAMP7P51809 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VAMP7P51809 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VAMP7P51809 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
VAMP7P51809 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
VAMP7P51809 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VAMP7P51809 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
VAMP7P51809 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VAMP7P51809 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VAMP7P51809 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VAMP7P51809 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
VAMP7P51809 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
VAMP7P51809 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VAMP7P51809 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VAMP7P51809 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VAMP7P51809 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VAMP7P51809 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VAMP7P51809 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VAMP7P51809 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
VAMP7P51809 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VAMP7P51809 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VAMP7P51809 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VAMP7P51809 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VAMP7P51809 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VAMP7P51809 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
VAMP7P51809 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
VAMP7P51809 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VAMP7P51809 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VAMP7P51809 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
VAMP7P51809 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
VAMP7P51809 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VAMP7P51809 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
VAMP7P51809 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VAMP7P51809 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
VAMP7P51809 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VAMP7P51809 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VAMP7P51809 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VAMP7P51809 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VAMP7P51809 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VAMP7P51809 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VAMP7P51809 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms