Protein–RNA interactions for Protein: P49721

PSMB2, Proteasome subunit beta type-2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB2P49721 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMB2P49721 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMB2P49721 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PSMB2P49721 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
PSMB2P49721 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB2P49721 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB2P49721 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB2P49721 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB2P49721 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB2P49721 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB2P49721 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB2P49721 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB2P49721 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB2P49721 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB2P49721 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB2P49721 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB2P49721 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB2P49721 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB2P49721 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB2P49721 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB2P49721 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB2P49721 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB2P49721 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB2P49721 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB2P49721 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB2P49721 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB2P49721 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB2P49721 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB2P49721 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB2P49721 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB2P49721 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB2P49721 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB2P49721 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB2P49721 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB2P49721 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB2P49721 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB2P49721 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB2P49721 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB2P49721 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB2P49721 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB2P49721 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB2P49721 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB2P49721 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB2P49721 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB2P49721 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB2P49721 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB2P49721 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMB2P49721 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMB2P49721 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMB2P49721 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMB2P49721 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMB2P49721 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMB2P49721 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMB2P49721 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMB2P49721 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMB2P49721 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMB2P49721 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMB2P49721 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMB2P49721 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMB2P49721 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMB2P49721 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMB2P49721 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMB2P49721 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMB2P49721 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMB2P49721 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMB2P49721 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMB2P49721 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMB2P49721 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMB2P49721 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMB2P49721 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB2P49721 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB2P49721 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB2P49721 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB2P49721 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB2P49721 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB2P49721 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB2P49721 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB2P49721 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB2P49721 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB2P49721 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB2P49721 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB2P49721 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB2P49721 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB2P49721 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB2P49721 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB2P49721 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB2P49721 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB2P49721 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB2P49721 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB2P49721 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB2P49721 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB2P49721 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB2P49721 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMB2P49721 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMB2P49721 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMB2P49721 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB2P49721 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB2P49721 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB2P49721 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB2P49721 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms