Protein–RNA interactions for Protein: P48029

SLC6A8, Sodium- and chloride-dependent creatine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A8P48029 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC6A8P48029 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC6A8P48029 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC6A8P48029 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC6A8P48029 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC6A8P48029 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC6A8P48029 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC6A8P48029 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC6A8P48029 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC6A8P48029 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC6A8P48029 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC6A8P48029 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC6A8P48029 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC6A8P48029 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC6A8P48029 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC6A8P48029 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC6A8P48029 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC6A8P48029 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC6A8P48029 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC6A8P48029 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC6A8P48029 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC6A8P48029 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC6A8P48029 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC6A8P48029 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC6A8P48029 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC6A8P48029 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC6A8P48029 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC6A8P48029 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC6A8P48029 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC6A8P48029 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC6A8P48029 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC6A8P48029 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC6A8P48029 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC6A8P48029 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC6A8P48029 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC6A8P48029 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC6A8P48029 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC6A8P48029 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC6A8P48029 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC6A8P48029 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC6A8P48029 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC6A8P48029 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC6A8P48029 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC6A8P48029 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC6A8P48029 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC6A8P48029 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC6A8P48029 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC6A8P48029 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC6A8P48029 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC6A8P48029 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC6A8P48029 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC6A8P48029 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC6A8P48029 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC6A8P48029 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC6A8P48029 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC6A8P48029 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC6A8P48029 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC6A8P48029 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC6A8P48029 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC6A8P48029 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC6A8P48029 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC6A8P48029 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC6A8P48029 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC6A8P48029 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC6A8P48029 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC6A8P48029 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC6A8P48029 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC6A8P48029 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC6A8P48029 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC6A8P48029 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC6A8P48029 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC6A8P48029 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC6A8P48029 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC6A8P48029 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC6A8P48029 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC6A8P48029 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC6A8P48029 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC6A8P48029 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC6A8P48029 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC6A8P48029 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC6A8P48029 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC6A8P48029 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC6A8P48029 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC6A8P48029 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC6A8P48029 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC6A8P48029 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC6A8P48029 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC6A8P48029 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC6A8P48029 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC6A8P48029 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC6A8P48029 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC6A8P48029 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC6A8P48029 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC6A8P48029 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC6A8P48029 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC6A8P48029 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC6A8P48029 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC6A8P48029 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC6A8P48029 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC6A8P48029 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms