Protein–RNA interactions for Protein: P43003

SLC1A3, Excitatory amino acid transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A3P43003 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC1A3P43003 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC1A3P43003 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC1A3P43003 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC1A3P43003 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC1A3P43003 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC1A3P43003 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC1A3P43003 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC1A3P43003 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC1A3P43003 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC1A3P43003 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC1A3P43003 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC1A3P43003 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC1A3P43003 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC1A3P43003 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC1A3P43003 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC1A3P43003 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC1A3P43003 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC1A3P43003 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC1A3P43003 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC1A3P43003 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC1A3P43003 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC1A3P43003 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC1A3P43003 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC1A3P43003 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC1A3P43003 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC1A3P43003 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC1A3P43003 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC1A3P43003 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC1A3P43003 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC1A3P43003 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC1A3P43003 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC1A3P43003 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC1A3P43003 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC1A3P43003 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC1A3P43003 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC1A3P43003 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC1A3P43003 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC1A3P43003 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC1A3P43003 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC1A3P43003 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC1A3P43003 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC1A3P43003 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC1A3P43003 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC1A3P43003 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC1A3P43003 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC1A3P43003 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC1A3P43003 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC1A3P43003 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC1A3P43003 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC1A3P43003 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC1A3P43003 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC1A3P43003 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC1A3P43003 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC1A3P43003 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC1A3P43003 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC1A3P43003 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC1A3P43003 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC1A3P43003 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC1A3P43003 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC1A3P43003 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC1A3P43003 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC1A3P43003 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC1A3P43003 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC1A3P43003 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC1A3P43003 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC1A3P43003 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC1A3P43003 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC1A3P43003 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC1A3P43003 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC1A3P43003 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC1A3P43003 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC1A3P43003 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC1A3P43003 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC1A3P43003 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC1A3P43003 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC1A3P43003 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC1A3P43003 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC1A3P43003 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC1A3P43003 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC1A3P43003 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC1A3P43003 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC1A3P43003 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC1A3P43003 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A3P43003 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A3P43003 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A3P43003 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A3P43003 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A3P43003 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A3P43003 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A3P43003 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A3P43003 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A3P43003 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A3P43003 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A3P43003 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A3P43003 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A3P43003 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC1A3P43003 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC1A3P43003 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC1A3P43003 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms