Protein–RNA interactions for Protein: P41279

MAP3K8, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K8P41279 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAP3K8P41279 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAP3K8P41279 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAP3K8P41279 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAP3K8P41279 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAP3K8P41279 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAP3K8P41279 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAP3K8P41279 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAP3K8P41279 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAP3K8P41279 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAP3K8P41279 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MAP3K8P41279 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MAP3K8P41279 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAP3K8P41279 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAP3K8P41279 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAP3K8P41279 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAP3K8P41279 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAP3K8P41279 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAP3K8P41279 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAP3K8P41279 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAP3K8P41279 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAP3K8P41279 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAP3K8P41279 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MAP3K8P41279 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAP3K8P41279 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAP3K8P41279 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAP3K8P41279 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAP3K8P41279 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAP3K8P41279 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAP3K8P41279 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MAP3K8P41279 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAP3K8P41279 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAP3K8P41279 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAP3K8P41279 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAP3K8P41279 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAP3K8P41279 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAP3K8P41279 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAP3K8P41279 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAP3K8P41279 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAP3K8P41279 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAP3K8P41279 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAP3K8P41279 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAP3K8P41279 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MAP3K8P41279 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MAP3K8P41279 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MAP3K8P41279 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MAP3K8P41279 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MAP3K8P41279 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MAP3K8P41279 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MAP3K8P41279 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MAP3K8P41279 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MAP3K8P41279 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MAP3K8P41279 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MAP3K8P41279 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MAP3K8P41279 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MAP3K8P41279 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MAP3K8P41279 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MAP3K8P41279 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MAP3K8P41279 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MAP3K8P41279 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAP3K8P41279 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAP3K8P41279 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MAP3K8P41279 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAP3K8P41279 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAP3K8P41279 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAP3K8P41279 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAP3K8P41279 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAP3K8P41279 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAP3K8P41279 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MAP3K8P41279 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAP3K8P41279 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAP3K8P41279 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAP3K8P41279 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MAP3K8P41279 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAP3K8P41279 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAP3K8P41279 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAP3K8P41279 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAP3K8P41279 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAP3K8P41279 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAP3K8P41279 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAP3K8P41279 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAP3K8P41279 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAP3K8P41279 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAP3K8P41279 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAP3K8P41279 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAP3K8P41279 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAP3K8P41279 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAP3K8P41279 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAP3K8P41279 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAP3K8P41279 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAP3K8P41279 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAP3K8P41279 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAP3K8P41279 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAP3K8P41279 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAP3K8P41279 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MAP3K8P41279 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAP3K8P41279 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAP3K8P41279 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAP3K8P41279 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAP3K8P41279 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 305.5 ms