Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
KDM5CP41229 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
KDM5CP41229 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
KDM5CP41229 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.62
KDM5CP41229 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.62
KDM5CP41229 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
KDM5CP41229 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
KDM5CP41229 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
KDM5CP41229 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
KDM5CP41229 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
KDM5CP41229 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
KDM5CP41229 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC37.6■■■■□ 3.61
KDM5CP41229 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
KDM5CP41229 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
KDM5CP41229 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
KDM5CP41229 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
KDM5CP41229 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
KDM5CP41229 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
KDM5CP41229 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.61
KDM5CP41229 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
KDM5CP41229 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
KDM5CP41229 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
KDM5CP41229 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
KDM5CP41229 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
KDM5CP41229 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
KDM5CP41229 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
KDM5CP41229 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
KDM5CP41229 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
KDM5CP41229 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC37.55■■■■□ 3.6
KDM5CP41229 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
KDM5CP41229 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
KDM5CP41229 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
KDM5CP41229 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
KDM5CP41229 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
KDM5CP41229 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
KDM5CP41229 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
KDM5CP41229 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
KDM5CP41229 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
KDM5CP41229 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
KDM5CP41229 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
KDM5CP41229 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.59
KDM5CP41229 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
KDM5CP41229 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
KDM5CP41229 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
KDM5CP41229 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
KDM5CP41229 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
KDM5CP41229 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
KDM5CP41229 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
KDM5CP41229 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
KDM5CP41229 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
KDM5CP41229 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
KDM5CP41229 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
KDM5CP41229 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
KDM5CP41229 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
KDM5CP41229 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC37.46■■■■□ 3.59
KDM5CP41229 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
KDM5CP41229 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
KDM5CP41229 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
KDM5CP41229 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
KDM5CP41229 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
KDM5CP41229 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
KDM5CP41229 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
KDM5CP41229 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
KDM5CP41229 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
KDM5CP41229 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
KDM5CP41229 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
KDM5CP41229 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
KDM5CP41229 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
KDM5CP41229 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
KDM5CP41229 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
KDM5CP41229 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC37.41■■■■□ 3.58
KDM5CP41229 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
KDM5CP41229 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
KDM5CP41229 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
KDM5CP41229 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
KDM5CP41229 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
KDM5CP41229 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.58
KDM5CP41229 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
KDM5CP41229 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
KDM5CP41229 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
KDM5CP41229 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
KDM5CP41229 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
KDM5CP41229 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.37■■■■□ 3.57
KDM5CP41229 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
KDM5CP41229 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
KDM5CP41229 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
KDM5CP41229 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
KDM5CP41229 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
KDM5CP41229 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC37.34■■■■□ 3.57
KDM5CP41229 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
KDM5CP41229 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
KDM5CP41229 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
KDM5CP41229 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
KDM5CP41229 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
KDM5CP41229 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
KDM5CP41229 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
KDM5CP41229 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
KDM5CP41229 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
KDM5CP41229 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
KDM5CP41229 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms