Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MDH1P40925 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MDH1P40925 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MDH1P40925 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MDH1P40925 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MDH1P40925 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MDH1P40925 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MDH1P40925 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MDH1P40925 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MDH1P40925 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MDH1P40925 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MDH1P40925 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MDH1P40925 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MDH1P40925 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MDH1P40925 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MDH1P40925 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MDH1P40925 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MDH1P40925 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MDH1P40925 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MDH1P40925 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MDH1P40925 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MDH1P40925 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MDH1P40925 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MDH1P40925 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MDH1P40925 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MDH1P40925 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MDH1P40925 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MDH1P40925 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
MDH1P40925 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MDH1P40925 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MDH1P40925 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MDH1P40925 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MDH1P40925 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MDH1P40925 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MDH1P40925 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MDH1P40925 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MDH1P40925 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MDH1P40925 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MDH1P40925 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MDH1P40925 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MDH1P40925 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MDH1P40925 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MDH1P40925 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MDH1P40925 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MDH1P40925 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MDH1P40925 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MDH1P40925 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MDH1P40925 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MDH1P40925 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MDH1P40925 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MDH1P40925 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MDH1P40925 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MDH1P40925 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MDH1P40925 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MDH1P40925 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MDH1P40925 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MDH1P40925 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MDH1P40925 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MDH1P40925 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MDH1P40925 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MDH1P40925 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MDH1P40925 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MDH1P40925 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MDH1P40925 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MDH1P40925 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MDH1P40925 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MDH1P40925 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MDH1P40925 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MDH1P40925 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MDH1P40925 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MDH1P40925 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MDH1P40925 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MDH1P40925 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MDH1P40925 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MDH1P40925 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MDH1P40925 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MDH1P40925 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MDH1P40925 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MDH1P40925 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MDH1P40925 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MDH1P40925 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MDH1P40925 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MDH1P40925 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MDH1P40925 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MDH1P40925 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MDH1P40925 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MDH1P40925 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MDH1P40925 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MDH1P40925 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MDH1P40925 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MDH1P40925 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MDH1P40925 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MDH1P40925 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MDH1P40925 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MDH1P40925 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MDH1P40925 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MDH1P40925 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MDH1P40925 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MDH1P40925 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MDH1P40925 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.6 ms