Protein–RNA interactions for Protein: P40617

ARL4A, ADP-ribosylation factor-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4AP40617 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARL4AP40617 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARL4AP40617 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARL4AP40617 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARL4AP40617 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARL4AP40617 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARL4AP40617 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARL4AP40617 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ARL4AP40617 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ARL4AP40617 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARL4AP40617 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARL4AP40617 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARL4AP40617 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARL4AP40617 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARL4AP40617 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARL4AP40617 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARL4AP40617 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARL4AP40617 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARL4AP40617 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARL4AP40617 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARL4AP40617 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARL4AP40617 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARL4AP40617 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARL4AP40617 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARL4AP40617 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARL4AP40617 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARL4AP40617 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARL4AP40617 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARL4AP40617 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARL4AP40617 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARL4AP40617 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARL4AP40617 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARL4AP40617 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARL4AP40617 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARL4AP40617 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARL4AP40617 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARL4AP40617 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARL4AP40617 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ARL4AP40617 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARL4AP40617 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARL4AP40617 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARL4AP40617 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARL4AP40617 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARL4AP40617 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ARL4AP40617 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARL4AP40617 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARL4AP40617 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARL4AP40617 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARL4AP40617 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARL4AP40617 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARL4AP40617 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARL4AP40617 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARL4AP40617 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARL4AP40617 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARL4AP40617 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARL4AP40617 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARL4AP40617 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARL4AP40617 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARL4AP40617 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARL4AP40617 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARL4AP40617 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARL4AP40617 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARL4AP40617 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARL4AP40617 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARL4AP40617 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARL4AP40617 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ARL4AP40617 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARL4AP40617 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARL4AP40617 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ARL4AP40617 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARL4AP40617 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARL4AP40617 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARL4AP40617 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARL4AP40617 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARL4AP40617 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARL4AP40617 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARL4AP40617 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARL4AP40617 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARL4AP40617 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARL4AP40617 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARL4AP40617 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARL4AP40617 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARL4AP40617 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ARL4AP40617 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARL4AP40617 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARL4AP40617 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARL4AP40617 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARL4AP40617 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARL4AP40617 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARL4AP40617 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARL4AP40617 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARL4AP40617 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARL4AP40617 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ARL4AP40617 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARL4AP40617 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARL4AP40617 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARL4AP40617 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARL4AP40617 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARL4AP40617 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARL4AP40617 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms