Protein–RNA interactions for Protein: P40486

SHQ1, Protein SHQ1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHQ1P40486 AGX1YFL030W 1158 nt7.23□□□□□ -1.25
SHQ1P40486 POR2YIL114C 846 nt7.23□□□□□ -1.25
SHQ1P40486 YLL056CYLL056C 897 nt7.22□□□□□ -1.25
SHQ1P40486 ASR1YPR093C 867 nt7.22□□□□□ -1.25
SHQ1P40486 HEM1YDR232W 1647 nt7.21□□□□□ -1.26
SHQ1P40486 YDR415CYDR415C 1125 nt7.21□□□□□ -1.26
SHQ1P40486 HIS1YER055C 894 nt7.21□□□□□ -1.26
SHQ1P40486 HEM2YGL040C 1029 nt7.21□□□□□ -1.26
SHQ1P40486 CTF8YHR191C 402 nt7.21□□□□□ -1.26
SHQ1P40486 DOT1YDR440W 1749 nt7.21□□□□□ -1.26
SHQ1P40486 ARP3YJR065C 1350 nt7.2□□□□□ -1.26
SHQ1P40486 NUP49YGL172W 1419 nt7.2□□□□□ -1.26
SHQ1P40486 PPM2YOL141W 2088 nt7.2□□□□□ -1.26
SHQ1P40486 MRPL35YDR322W 1104 nt7.2□□□□□ -1.26
SHQ1P40486 SUR7YML052W 909 nt7.2□□□□□ -1.26
SHQ1P40486 EDC3YEL015W 1656 nt7.19□□□□□ -1.26
SHQ1P40486 HEL1YKR017C 1656 nt7.19□□□□□ -1.26
SHQ1P40486 CUE4YML101C 354 nt7.19□□□□□ -1.26
SHQ1P40486 COQ1YBR003W 1422 nt7.18□□□□□ -1.26
SHQ1P40486 SMC5YOL034W 3282 nt7.18□□□□□ -1.26
SHQ1P40486 YPT1YFL038C 621 nt7.18□□□□□ -1.26
SHQ1P40486 AIM20YIL158W 615 nt7.18□□□□□ -1.26
SHQ1P40486 RSP5YER125W 2430 nt7.18□□□□□ -1.26
SHQ1P40486 PMP3YDR276C 168 nt7.17□□□□□ -1.26
SHQ1P40486 YKR032WYKR032W 315 nt7.17□□□□□ -1.26
SHQ1P40486 MRPL19YNL185C 477 nt7.17□□□□□ -1.26
SHQ1P40486 TMA46YOR091W 1038 nt7.17□□□□□ -1.26
SHQ1P40486 YPL136WYPL136W 369 nt7.17□□□□□ -1.26
SHQ1P40486 YPR204WYPR204W 3099 nt7.17□□□□□ -1.26
SHQ1P40486 YCR061WYCR061W 1896 nt7.16□□□□□ -1.26
SHQ1P40486 DFR1YOR236W 636 nt7.16□□□□□ -1.26
SHQ1P40486 FMP40YPL222W 2067 nt7.16□□□□□ -1.26
SHQ1P40486 CBK1YNL161W 2271 nt7.16□□□□□ -1.26
SHQ1P40486 EDE1YBL047C 4146 nt7.16□□□□□ -1.26
SHQ1P40486 ATG36YJL185C 882 nt7.15□□□□□ -1.26
SHQ1P40486 YJR154WYJR154W 1041 nt7.15□□□□□ -1.26
SHQ1P40486 FBA1YKL060C 1080 nt7.15□□□□□ -1.26
SHQ1P40486 YNL092WYNL092W 1203 nt7.15□□□□□ -1.26
SHQ1P40486 OPI7YDR360W 435 nt7.14□□□□□ -1.27
SHQ1P40486 YIL029W-AYIL029W-A 372 nt7.14□□□□□ -1.27
SHQ1P40486 MGM101YJR144W 810 nt7.14□□□□□ -1.27
SHQ1P40486 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt7.14□□□□□ -1.27
SHQ1P40486 SWD1YAR003W 1281 nt7.14□□□□□ -1.27
SHQ1P40486 MLS1YNL117W 1665 nt7.14□□□□□ -1.27
SHQ1P40486 YBR113WYBR113W 483 nt7.14□□□□□ -1.27
SHQ1P40486 GAL83YER027C 1254 nt7.13□□□□□ -1.27
SHQ1P40486 MIA40YKL195W 1212 nt7.13□□□□□ -1.27
SHQ1P40486 DID2YKR035W-A 615 nt7.13□□□□□ -1.27
SHQ1P40486 PMT3YOR321W 2262 nt7.13□□□□□ -1.27
SHQ1P40486 ARG81YML099C 2643 nt7.13□□□□□ -1.27
SHQ1P40486 SES1YDR023W 1389 nt7.12□□□□□ -1.27
SHQ1P40486 ASF1YJL115W 840 nt7.12□□□□□ -1.27
SHQ1P40486 COX5AYNL052W 462 nt7.12□□□□□ -1.27
SHQ1P40486 SKY1YMR216C 2229 nt7.12□□□□□ -1.27
SHQ1P40486 IMG1YCR046C 510 nt7.11□□□□□ -1.27
SHQ1P40486 SUF5tG(CCC)O 72 nt7.11□□□□□ -1.27
SHQ1P40486 LCL3YGL085W 825 nt7.11□□□□□ -1.27
SHQ1P40486 YKL077WYKL077W 1179 nt7.11□□□□□ -1.27
SHQ1P40486 TAF9YMR236W 474 nt7.1□□□□□ -1.27
SHQ1P40486 YNL120CYNL120C 486 nt7.1□□□□□ -1.27
SHQ1P40486 MRPS18YNL306W 654 nt7.1□□□□□ -1.27
SHQ1P40486 SCS22YBL091C-A 528 nt7.1□□□□□ -1.27
SHQ1P40486 UBP13YBL067C 2244 nt7.1□□□□□ -1.27
SHQ1P40486 MSY1YPL097W 1479 nt7.1□□□□□ -1.27
SHQ1P40486 UTR2YEL040W 1404 nt7.1□□□□□ -1.27
SHQ1P40486 CIR2YOR356W 1896 nt7.09□□□□□ -1.27
SHQ1P40486 FMO1YHR176W 1299 nt7.09□□□□□ -1.27
SHQ1P40486 SQT1YIR012W 1296 nt7.09□□□□□ -1.27
SHQ1P40486 MRPL23YOR150W 492 nt7.09□□□□□ -1.27
SHQ1P40486 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt7.09□□□□□ -1.27
SHQ1P40486 CRH1YGR189C 1524 nt7.09□□□□□ -1.27
SHQ1P40486 CCC2YDR270W 3015 nt7.09□□□□□ -1.27
SHQ1P40486 THI2YBR240C 1353 nt7.08□□□□□ -1.28
SHQ1P40486 SPG1YGR236C 288 nt7.08□□□□□ -1.28
SHQ1P40486 YKL153WYKL153W 510 nt7.08□□□□□ -1.28
SHQ1P40486 YLR184WYLR184W 348 nt7.08□□□□□ -1.28
SHQ1P40486 RFC4YOL094C 972 nt7.08□□□□□ -1.28
SHQ1P40486 SAL1YNL083W 1485 nt7.07□□□□□ -1.28
SHQ1P40486 YJR146WYJR146W 354 nt7.07□□□□□ -1.28
SHQ1P40486 YLR312CYLR312C 1197 nt7.07□□□□□ -1.28
SHQ1P40486 CLN1YMR199W 1641 nt7.07□□□□□ -1.28
SHQ1P40486 PHO3YBR092C 1404 nt7.07□□□□□ -1.28
SHQ1P40486 COX10YPL172C 1389 nt7.07□□□□□ -1.28
SHQ1P40486 YKL102CYKL102C 306 nt7.06□□□□□ -1.28
SHQ1P40486 AIM33YML087C 939 nt7.06□□□□□ -1.28
SHQ1P40486 KSH1YNL024C-A 219 nt7.06□□□□□ -1.28
SHQ1P40486 GCG1YER163C 699 nt7.05□□□□□ -1.28
SHQ1P40486 RPP1YHR062C 882 nt7.05□□□□□ -1.28
SHQ1P40486 OGG1YML060W 1131 nt7.05□□□□□ -1.28
SHQ1P40486 ILV6YCL009C 930 nt7.05□□□□□ -1.28
SHQ1P40486 GLN3YER040W 2193 nt7.05□□□□□ -1.28
SHQ1P40486 PAB1YER165W 1734 nt7.04□□□□□ -1.28
SHQ1P40486 FPR2YDR519W 408 nt7.04□□□□□ -1.28
SHQ1P40486 YLR123CYLR123C 330 nt7.04□□□□□ -1.28
SHQ1P40486 LSC1YOR142W 990 nt7.03□□□□□ -1.28
SHQ1P40486 YPL257WYPL257W 582 nt7.02□□□□□ -1.29
SHQ1P40486 RBS1YDL189W 1374 nt7.01□□□□□ -1.29
SHQ1P40486 RNH1YMR234W 1047 nt7.01□□□□□ -1.29
SHQ1P40486 AGP2YBR132C 1791 nt7□□□□□ -1.29
SHQ1P40486 DAL7YIR031C 1665 nt7□□□□□ -1.29
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