Protein–RNA interactions for Protein: P35241

RDX, Radixin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDXP35241 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RDXP35241 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RDXP35241 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RDXP35241 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RDXP35241 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RDXP35241 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RDXP35241 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RDXP35241 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RDXP35241 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RDXP35241 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RDXP35241 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RDXP35241 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RDXP35241 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RDXP35241 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RDXP35241 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
RDXP35241 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RDXP35241 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RDXP35241 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RDXP35241 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RDXP35241 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RDXP35241 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RDXP35241 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RDXP35241 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RDXP35241 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RDXP35241 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RDXP35241 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RDXP35241 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RDXP35241 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RDXP35241 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RDXP35241 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RDXP35241 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RDXP35241 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RDXP35241 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RDXP35241 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RDXP35241 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RDXP35241 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RDXP35241 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RDXP35241 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RDXP35241 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RDXP35241 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RDXP35241 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RDXP35241 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RDXP35241 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RDXP35241 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RDXP35241 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RDXP35241 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RDXP35241 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RDXP35241 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RDXP35241 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RDXP35241 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RDXP35241 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RDXP35241 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RDXP35241 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RDXP35241 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RDXP35241 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RDXP35241 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RDXP35241 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RDXP35241 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RDXP35241 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RDXP35241 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RDXP35241 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RDXP35241 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RDXP35241 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RDXP35241 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RDXP35241 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RDXP35241 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RDXP35241 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RDXP35241 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RDXP35241 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RDXP35241 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RDXP35241 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RDXP35241 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RDXP35241 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RDXP35241 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RDXP35241 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RDXP35241 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RDXP35241 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RDXP35241 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RDXP35241 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RDXP35241 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RDXP35241 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RDXP35241 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RDXP35241 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RDXP35241 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RDXP35241 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RDXP35241 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RDXP35241 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RDXP35241 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RDXP35241 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
RDXP35241 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RDXP35241 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RDXP35241 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RDXP35241 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RDXP35241 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RDXP35241 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RDXP35241 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RDXP35241 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RDXP35241 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RDXP35241 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RDXP35241 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms