Protein–RNA interactions for Protein: P30304

CDC25A, M-phase inducer phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC25AP30304 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDC25AP30304 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDC25AP30304 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDC25AP30304 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDC25AP30304 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDC25AP30304 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDC25AP30304 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDC25AP30304 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDC25AP30304 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDC25AP30304 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDC25AP30304 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDC25AP30304 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDC25AP30304 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDC25AP30304 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDC25AP30304 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDC25AP30304 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDC25AP30304 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDC25AP30304 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDC25AP30304 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDC25AP30304 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDC25AP30304 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDC25AP30304 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDC25AP30304 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDC25AP30304 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDC25AP30304 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDC25AP30304 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDC25AP30304 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDC25AP30304 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDC25AP30304 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDC25AP30304 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CDC25AP30304 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDC25AP30304 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CDC25AP30304 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CDC25AP30304 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDC25AP30304 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDC25AP30304 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDC25AP30304 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDC25AP30304 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CDC25AP30304 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDC25AP30304 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDC25AP30304 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDC25AP30304 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDC25AP30304 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDC25AP30304 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDC25AP30304 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDC25AP30304 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDC25AP30304 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDC25AP30304 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDC25AP30304 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDC25AP30304 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDC25AP30304 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDC25AP30304 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDC25AP30304 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDC25AP30304 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CDC25AP30304 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDC25AP30304 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDC25AP30304 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CDC25AP30304 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CDC25AP30304 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDC25AP30304 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDC25AP30304 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CDC25AP30304 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CDC25AP30304 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDC25AP30304 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDC25AP30304 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDC25AP30304 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDC25AP30304 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDC25AP30304 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDC25AP30304 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDC25AP30304 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDC25AP30304 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDC25AP30304 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDC25AP30304 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDC25AP30304 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CDC25AP30304 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDC25AP30304 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDC25AP30304 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDC25AP30304 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDC25AP30304 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDC25AP30304 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDC25AP30304 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDC25AP30304 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDC25AP30304 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDC25AP30304 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDC25AP30304 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDC25AP30304 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDC25AP30304 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDC25AP30304 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
CDC25AP30304 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CDC25AP30304 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDC25AP30304 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CDC25AP30304 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDC25AP30304 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDC25AP30304 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDC25AP30304 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CDC25AP30304 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CDC25AP30304 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CDC25AP30304 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDC25AP30304 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CDC25AP30304 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms