Protein–RNA interactions for Protein: P29508

SERPINB3, Serpin B3, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINB3P29508 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SERPINB3P29508 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SERPINB3P29508 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SERPINB3P29508 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SERPINB3P29508 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SERPINB3P29508 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SERPINB3P29508 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SERPINB3P29508 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SERPINB3P29508 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SERPINB3P29508 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SERPINB3P29508 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SERPINB3P29508 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SERPINB3P29508 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SERPINB3P29508 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SERPINB3P29508 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SERPINB3P29508 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SERPINB3P29508 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SERPINB3P29508 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SERPINB3P29508 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SERPINB3P29508 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SERPINB3P29508 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SERPINB3P29508 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SERPINB3P29508 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SERPINB3P29508 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SERPINB3P29508 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SERPINB3P29508 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SERPINB3P29508 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SERPINB3P29508 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SERPINB3P29508 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SERPINB3P29508 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SERPINB3P29508 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SERPINB3P29508 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SERPINB3P29508 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SERPINB3P29508 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SERPINB3P29508 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SERPINB3P29508 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SERPINB3P29508 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SERPINB3P29508 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SERPINB3P29508 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SERPINB3P29508 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SERPINB3P29508 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SERPINB3P29508 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SERPINB3P29508 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SERPINB3P29508 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SERPINB3P29508 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SERPINB3P29508 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SERPINB3P29508 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SERPINB3P29508 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SERPINB3P29508 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SERPINB3P29508 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SERPINB3P29508 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SERPINB3P29508 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SERPINB3P29508 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SERPINB3P29508 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SERPINB3P29508 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SERPINB3P29508 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SERPINB3P29508 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SERPINB3P29508 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SERPINB3P29508 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SERPINB3P29508 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SERPINB3P29508 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SERPINB3P29508 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SERPINB3P29508 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SERPINB3P29508 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SERPINB3P29508 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SERPINB3P29508 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SERPINB3P29508 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SERPINB3P29508 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SERPINB3P29508 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SERPINB3P29508 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SERPINB3P29508 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SERPINB3P29508 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SERPINB3P29508 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SERPINB3P29508 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SERPINB3P29508 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SERPINB3P29508 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SERPINB3P29508 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SERPINB3P29508 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SERPINB3P29508 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SERPINB3P29508 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SERPINB3P29508 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SERPINB3P29508 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SERPINB3P29508 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SERPINB3P29508 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SERPINB3P29508 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SERPINB3P29508 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SERPINB3P29508 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SERPINB3P29508 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SERPINB3P29508 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SERPINB3P29508 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SERPINB3P29508 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SERPINB3P29508 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SERPINB3P29508 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SERPINB3P29508 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SERPINB3P29508 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SERPINB3P29508 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SERPINB3P29508 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SERPINB3P29508 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SERPINB3P29508 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SERPINB3P29508 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms