Protein–RNA interactions for Protein: P28566

HTR1E, 5-hydroxytryptamine receptor 1E, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1EP28566 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTR1EP28566 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTR1EP28566 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTR1EP28566 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTR1EP28566 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTR1EP28566 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTR1EP28566 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTR1EP28566 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTR1EP28566 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HTR1EP28566 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HTR1EP28566 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HTR1EP28566 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HTR1EP28566 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HTR1EP28566 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HTR1EP28566 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HTR1EP28566 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HTR1EP28566 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HTR1EP28566 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTR1EP28566 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTR1EP28566 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HTR1EP28566 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HTR1EP28566 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HTR1EP28566 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTR1EP28566 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTR1EP28566 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTR1EP28566 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTR1EP28566 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTR1EP28566 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTR1EP28566 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTR1EP28566 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTR1EP28566 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTR1EP28566 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTR1EP28566 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTR1EP28566 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTR1EP28566 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HTR1EP28566 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTR1EP28566 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTR1EP28566 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTR1EP28566 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTR1EP28566 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTR1EP28566 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTR1EP28566 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTR1EP28566 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HTR1EP28566 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HTR1EP28566 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HTR1EP28566 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HTR1EP28566 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HTR1EP28566 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HTR1EP28566 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HTR1EP28566 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HTR1EP28566 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HTR1EP28566 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HTR1EP28566 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HTR1EP28566 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HTR1EP28566 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HTR1EP28566 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HTR1EP28566 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HTR1EP28566 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HTR1EP28566 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HTR1EP28566 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HTR1EP28566 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HTR1EP28566 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HTR1EP28566 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HTR1EP28566 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HTR1EP28566 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HTR1EP28566 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HTR1EP28566 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HTR1EP28566 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HTR1EP28566 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HTR1EP28566 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HTR1EP28566 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HTR1EP28566 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HTR1EP28566 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HTR1EP28566 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HTR1EP28566 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HTR1EP28566 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HTR1EP28566 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HTR1EP28566 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HTR1EP28566 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HTR1EP28566 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HTR1EP28566 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HTR1EP28566 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HTR1EP28566 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HTR1EP28566 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HTR1EP28566 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HTR1EP28566 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HTR1EP28566 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HTR1EP28566 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HTR1EP28566 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HTR1EP28566 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HTR1EP28566 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HTR1EP28566 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HTR1EP28566 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HTR1EP28566 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HTR1EP28566 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTR1EP28566 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTR1EP28566 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTR1EP28566 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HTR1EP28566 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTR1EP28566 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms