Protein–RNA interactions for Protein: P28069

POU1F1, Pituitary-specific positive transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU1F1P28069 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POU1F1P28069 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POU1F1P28069 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POU1F1P28069 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
POU1F1P28069 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
POU1F1P28069 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
POU1F1P28069 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
POU1F1P28069 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POU1F1P28069 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POU1F1P28069 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POU1F1P28069 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
POU1F1P28069 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POU1F1P28069 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
POU1F1P28069 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POU1F1P28069 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POU1F1P28069 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POU1F1P28069 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POU1F1P28069 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POU1F1P28069 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POU1F1P28069 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POU1F1P28069 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POU1F1P28069 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POU1F1P28069 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POU1F1P28069 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POU1F1P28069 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POU1F1P28069 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POU1F1P28069 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POU1F1P28069 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POU1F1P28069 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POU1F1P28069 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POU1F1P28069 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POU1F1P28069 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POU1F1P28069 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POU1F1P28069 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POU1F1P28069 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POU1F1P28069 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POU1F1P28069 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POU1F1P28069 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POU1F1P28069 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POU1F1P28069 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POU1F1P28069 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POU1F1P28069 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POU1F1P28069 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POU1F1P28069 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POU1F1P28069 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POU1F1P28069 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POU1F1P28069 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POU1F1P28069 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POU1F1P28069 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POU1F1P28069 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POU1F1P28069 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POU1F1P28069 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POU1F1P28069 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POU1F1P28069 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
POU1F1P28069 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
POU1F1P28069 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
POU1F1P28069 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POU1F1P28069 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POU1F1P28069 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POU1F1P28069 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POU1F1P28069 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POU1F1P28069 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POU1F1P28069 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POU1F1P28069 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POU1F1P28069 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POU1F1P28069 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
POU1F1P28069 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POU1F1P28069 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POU1F1P28069 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POU1F1P28069 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POU1F1P28069 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POU1F1P28069 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POU1F1P28069 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POU1F1P28069 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POU1F1P28069 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POU1F1P28069 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POU1F1P28069 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POU1F1P28069 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POU1F1P28069 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POU1F1P28069 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POU1F1P28069 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POU1F1P28069 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POU1F1P28069 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POU1F1P28069 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POU1F1P28069 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POU1F1P28069 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POU1F1P28069 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POU1F1P28069 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POU1F1P28069 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POU1F1P28069 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POU1F1P28069 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
POU1F1P28069 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POU1F1P28069 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POU1F1P28069 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POU1F1P28069 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
POU1F1P28069 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POU1F1P28069 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POU1F1P28069 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POU1F1P28069 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
POU1F1P28069 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms