Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAMA1P25391 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAMA1P25391 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LAMA1P25391 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LAMA1P25391 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LAMA1P25391 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LAMA1P25391 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LAMA1P25391 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LAMA1P25391 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LAMA1P25391 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LAMA1P25391 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMA1P25391 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMA1P25391 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMA1P25391 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMA1P25391 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMA1P25391 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMA1P25391 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMA1P25391 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMA1P25391 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMA1P25391 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMA1P25391 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMA1P25391 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMA1P25391 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMA1P25391 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMA1P25391 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMA1P25391 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMA1P25391 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMA1P25391 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMA1P25391 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMA1P25391 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMA1P25391 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMA1P25391 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LAMA1P25391 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LAMA1P25391 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LAMA1P25391 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LAMA1P25391 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LAMA1P25391 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
LAMA1P25391 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMA1P25391 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMA1P25391 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMA1P25391 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMA1P25391 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMA1P25391 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMA1P25391 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMA1P25391 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMA1P25391 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMA1P25391 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMA1P25391 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMA1P25391 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMA1P25391 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMA1P25391 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMA1P25391 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMA1P25391 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMA1P25391 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMA1P25391 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMA1P25391 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMA1P25391 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMA1P25391 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMA1P25391 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMA1P25391 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMA1P25391 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMA1P25391 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMA1P25391 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMA1P25391 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMA1P25391 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMA1P25391 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LAMA1P25391 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LAMA1P25391 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LAMA1P25391 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LAMA1P25391 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMA1P25391 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMA1P25391 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMA1P25391 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMA1P25391 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMA1P25391 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMA1P25391 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMA1P25391 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMA1P25391 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMA1P25391 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMA1P25391 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMA1P25391 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMA1P25391 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMA1P25391 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMA1P25391 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMA1P25391 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMA1P25391 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMA1P25391 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMA1P25391 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMA1P25391 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMA1P25391 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMA1P25391 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMA1P25391 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMA1P25391 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMA1P25391 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMA1P25391 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMA1P25391 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMA1P25391 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMA1P25391 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMA1P25391 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMA1P25391 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms