Protein–RNA interactions for Protein: P23759

PAX7, Paired box protein Pax-7, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX7P23759 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAX7P23759 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PAX7P23759 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PAX7P23759 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PAX7P23759 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PAX7P23759 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PAX7P23759 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PAX7P23759 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAX7P23759 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAX7P23759 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAX7P23759 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAX7P23759 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAX7P23759 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAX7P23759 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAX7P23759 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAX7P23759 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAX7P23759 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAX7P23759 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAX7P23759 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAX7P23759 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAX7P23759 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAX7P23759 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAX7P23759 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAX7P23759 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAX7P23759 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAX7P23759 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAX7P23759 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAX7P23759 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAX7P23759 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAX7P23759 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAX7P23759 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAX7P23759 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PAX7P23759 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAX7P23759 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAX7P23759 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAX7P23759 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAX7P23759 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAX7P23759 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAX7P23759 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAX7P23759 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAX7P23759 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAX7P23759 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAX7P23759 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAX7P23759 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAX7P23759 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAX7P23759 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PAX7P23759 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAX7P23759 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAX7P23759 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAX7P23759 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAX7P23759 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAX7P23759 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAX7P23759 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAX7P23759 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAX7P23759 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAX7P23759 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAX7P23759 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAX7P23759 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAX7P23759 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAX7P23759 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PAX7P23759 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAX7P23759 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAX7P23759 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAX7P23759 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAX7P23759 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PAX7P23759 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAX7P23759 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAX7P23759 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAX7P23759 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAX7P23759 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAX7P23759 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAX7P23759 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAX7P23759 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAX7P23759 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PAX7P23759 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAX7P23759 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAX7P23759 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAX7P23759 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAX7P23759 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAX7P23759 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAX7P23759 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAX7P23759 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAX7P23759 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAX7P23759 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAX7P23759 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAX7P23759 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAX7P23759 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAX7P23759 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAX7P23759 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAX7P23759 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAX7P23759 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAX7P23759 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAX7P23759 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAX7P23759 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAX7P23759 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAX7P23759 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAX7P23759 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PAX7P23759 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PAX7P23759 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PAX7P23759 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms