Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
HRCP23327 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC38■■■■□ 3.67
HRCP23327 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
HRCP23327 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
HRCP23327 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
HRCP23327 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
HRCP23327 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
HRCP23327 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
HRCP23327 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
HRCP23327 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
HRCP23327 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
HRCP23327 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC37.99■■■■□ 3.67
HRCP23327 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
HRCP23327 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
HRCP23327 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
HRCP23327 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
HRCP23327 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
HRCP23327 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
HRCP23327 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
HRCP23327 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
HRCP23327 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
HRCP23327 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
HRCP23327 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
HRCP23327 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC37.96■■■■□ 3.67
HRCP23327 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
HRCP23327 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
HRCP23327 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
HRCP23327 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
HRCP23327 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.66
HRCP23327 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
HRCP23327 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
HRCP23327 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
HRCP23327 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
HRCP23327 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
HRCP23327 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
HRCP23327 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
HRCP23327 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
HRCP23327 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
HRCP23327 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC37.91■■■■□ 3.66
HRCP23327 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
HRCP23327 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
HRCP23327 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
HRCP23327 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
HRCP23327 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
HRCP23327 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
HRCP23327 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
HRCP23327 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
HRCP23327 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
HRCP23327 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
HRCP23327 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
HRCP23327 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
HRCP23327 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
HRCP23327 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
HRCP23327 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
HRCP23327 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
HRCP23327 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
HRCP23327 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
HRCP23327 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
HRCP23327 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
HRCP23327 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
HRCP23327 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
HRCP23327 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
HRCP23327 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
HRCP23327 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC37.85■■■■□ 3.65
HRCP23327 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
HRCP23327 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
HRCP23327 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
HRCP23327 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
HRCP23327 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC37.84■■■■□ 3.65
HRCP23327 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
HRCP23327 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
HRCP23327 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
HRCP23327 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
HRCP23327 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
HRCP23327 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.65
HRCP23327 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
HRCP23327 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
HRCP23327 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
HRCP23327 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
HRCP23327 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
HRCP23327 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
HRCP23327 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
HRCP23327 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
HRCP23327 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC37.79■■■■□ 3.64
HRCP23327 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
HRCP23327 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
HRCP23327 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
HRCP23327 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC37.78■■■■□ 3.64
HRCP23327 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
HRCP23327 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
HRCP23327 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
HRCP23327 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
HRCP23327 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
HRCP23327 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
HRCP23327 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
HRCP23327 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
HRCP23327 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
HRCP23327 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
HRCP23327 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
HRCP23327 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms