Protein–RNA interactions for Protein: P21399

ACO1, Cytoplasmic aconitate hydratase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACO1P21399 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ACO1P21399 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ACO1P21399 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ACO1P21399 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ACO1P21399 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ACO1P21399 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ACO1P21399 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ACO1P21399 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ACO1P21399 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ACO1P21399 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ACO1P21399 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ACO1P21399 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ACO1P21399 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ACO1P21399 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ACO1P21399 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ACO1P21399 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ACO1P21399 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ACO1P21399 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ACO1P21399 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ACO1P21399 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ACO1P21399 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ACO1P21399 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ACO1P21399 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ACO1P21399 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ACO1P21399 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ACO1P21399 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ACO1P21399 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ACO1P21399 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ACO1P21399 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ACO1P21399 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ACO1P21399 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ACO1P21399 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ACO1P21399 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ACO1P21399 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ACO1P21399 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ACO1P21399 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ACO1P21399 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ACO1P21399 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ACO1P21399 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ACO1P21399 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ACO1P21399 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ACO1P21399 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ACO1P21399 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ACO1P21399 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ACO1P21399 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ACO1P21399 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ACO1P21399 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ACO1P21399 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ACO1P21399 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ACO1P21399 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ACO1P21399 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ACO1P21399 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ACO1P21399 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ACO1P21399 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ACO1P21399 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ACO1P21399 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ACO1P21399 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ACO1P21399 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ACO1P21399 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ACO1P21399 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ACO1P21399 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ACO1P21399 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ACO1P21399 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ACO1P21399 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ACO1P21399 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ACO1P21399 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ACO1P21399 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ACO1P21399 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ACO1P21399 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ACO1P21399 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ACO1P21399 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ACO1P21399 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ACO1P21399 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ACO1P21399 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ACO1P21399 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ACO1P21399 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ACO1P21399 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ACO1P21399 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ACO1P21399 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ACO1P21399 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
ACO1P21399 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ACO1P21399 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ACO1P21399 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ACO1P21399 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ACO1P21399 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ACO1P21399 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ACO1P21399 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ACO1P21399 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ACO1P21399 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ACO1P21399 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ACO1P21399 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ACO1P21399 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ACO1P21399 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ACO1P21399 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ACO1P21399 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ACO1P21399 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ACO1P21399 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ACO1P21399 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ACO1P21399 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ACO1P21399 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.6 ms