Protein–RNA interactions for Protein: P20807

CAPN3, Calpain-3, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3P20807 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN3P20807 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN3P20807 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN3P20807 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN3P20807 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN3P20807 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN3P20807 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN3P20807 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN3P20807 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN3P20807 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN3P20807 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN3P20807 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN3P20807 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPN3P20807 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPN3P20807 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPN3P20807 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPN3P20807 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CAPN3P20807 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN3P20807 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN3P20807 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN3P20807 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN3P20807 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN3P20807 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN3P20807 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN3P20807 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN3P20807 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN3P20807 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN3P20807 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN3P20807 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN3P20807 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN3P20807 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN3P20807 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN3P20807 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN3P20807 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN3P20807 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPN3P20807 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPN3P20807 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN3P20807 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN3P20807 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN3P20807 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN3P20807 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN3P20807 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN3P20807 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN3P20807 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN3P20807 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN3P20807 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN3P20807 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN3P20807 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN3P20807 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN3P20807 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN3P20807 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN3P20807 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN3P20807 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN3P20807 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN3P20807 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN3P20807 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN3P20807 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CAPN3P20807 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CAPN3P20807 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CAPN3P20807 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CAPN3P20807 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN3P20807 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN3P20807 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN3P20807 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN3P20807 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN3P20807 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN3P20807 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN3P20807 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN3P20807 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN3P20807 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN3P20807 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN3P20807 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN3P20807 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN3P20807 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN3P20807 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN3P20807 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN3P20807 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN3P20807 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN3P20807 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN3P20807 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN3P20807 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN3P20807 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN3P20807 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN3P20807 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN3P20807 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN3P20807 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN3P20807 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN3P20807 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN3P20807 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN3P20807 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN3P20807 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN3P20807 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN3P20807 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN3P20807 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN3P20807 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN3P20807 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CAPN3P20807 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CAPN3P20807 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPN3P20807 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPN3P20807 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms