Protein–RNA interactions for Protein: P17040

ZSCAN20, Zinc finger and SCAN domain-containing protein 20, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSCAN20P17040 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ZSCAN20P17040 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZSCAN20P17040 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZSCAN20P17040 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZSCAN20P17040 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ZSCAN20P17040 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZSCAN20P17040 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZSCAN20P17040 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZSCAN20P17040 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ZSCAN20P17040 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ZSCAN20P17040 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ZSCAN20P17040 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZSCAN20P17040 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZSCAN20P17040 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
ZSCAN20P17040 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZSCAN20P17040 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
ZSCAN20P17040 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ZSCAN20P17040 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZSCAN20P17040 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ZSCAN20P17040 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZSCAN20P17040 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZSCAN20P17040 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ZSCAN20P17040 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ZSCAN20P17040 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZSCAN20P17040 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ZSCAN20P17040 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZSCAN20P17040 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZSCAN20P17040 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZSCAN20P17040 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ZSCAN20P17040 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZSCAN20P17040 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZSCAN20P17040 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ZSCAN20P17040 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZSCAN20P17040 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZSCAN20P17040 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZSCAN20P17040 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZSCAN20P17040 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZSCAN20P17040 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZSCAN20P17040 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ZSCAN20P17040 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZSCAN20P17040 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZSCAN20P17040 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZSCAN20P17040 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZSCAN20P17040 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZSCAN20P17040 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZSCAN20P17040 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZSCAN20P17040 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZSCAN20P17040 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZSCAN20P17040 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZSCAN20P17040 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZSCAN20P17040 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZSCAN20P17040 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZSCAN20P17040 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZSCAN20P17040 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZSCAN20P17040 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZSCAN20P17040 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZSCAN20P17040 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZSCAN20P17040 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZSCAN20P17040 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZSCAN20P17040 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZSCAN20P17040 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ZSCAN20P17040 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ZSCAN20P17040 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ZSCAN20P17040 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ZSCAN20P17040 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
ZSCAN20P17040 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZSCAN20P17040 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZSCAN20P17040 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZSCAN20P17040 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZSCAN20P17040 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZSCAN20P17040 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZSCAN20P17040 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZSCAN20P17040 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZSCAN20P17040 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZSCAN20P17040 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZSCAN20P17040 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZSCAN20P17040 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZSCAN20P17040 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZSCAN20P17040 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZSCAN20P17040 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZSCAN20P17040 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZSCAN20P17040 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZSCAN20P17040 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZSCAN20P17040 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZSCAN20P17040 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZSCAN20P17040 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZSCAN20P17040 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZSCAN20P17040 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZSCAN20P17040 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZSCAN20P17040 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZSCAN20P17040 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZSCAN20P17040 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZSCAN20P17040 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZSCAN20P17040 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZSCAN20P17040 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZSCAN20P17040 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZSCAN20P17040 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZSCAN20P17040 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZSCAN20P17040 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZSCAN20P17040 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms