Protein–RNA interactions for Protein: P15918

RAG1, V(D)J recombination-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG1P15918 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAG1P15918 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAG1P15918 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAG1P15918 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAG1P15918 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAG1P15918 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAG1P15918 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAG1P15918 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAG1P15918 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAG1P15918 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAG1P15918 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAG1P15918 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
RAG1P15918 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAG1P15918 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RAG1P15918 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RAG1P15918 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAG1P15918 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
RAG1P15918 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAG1P15918 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAG1P15918 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAG1P15918 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAG1P15918 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAG1P15918 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAG1P15918 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAG1P15918 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
RAG1P15918 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.96
RAG1P15918 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAG1P15918 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAG1P15918 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAG1P15918 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAG1P15918 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAG1P15918 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAG1P15918 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAG1P15918 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAG1P15918 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAG1P15918 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAG1P15918 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAG1P15918 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAG1P15918 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAG1P15918 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAG1P15918 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAG1P15918 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAG1P15918 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAG1P15918 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAG1P15918 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAG1P15918 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAG1P15918 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RAG1P15918 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RAG1P15918 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RAG1P15918 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RAG1P15918 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RAG1P15918 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RAG1P15918 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RAG1P15918 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RAG1P15918 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAG1P15918 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAG1P15918 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAG1P15918 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAG1P15918 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAG1P15918 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAG1P15918 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAG1P15918 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAG1P15918 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RAG1P15918 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RAG1P15918 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RAG1P15918 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAG1P15918 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAG1P15918 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAG1P15918 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAG1P15918 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAG1P15918 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAG1P15918 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAG1P15918 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAG1P15918 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAG1P15918 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAG1P15918 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAG1P15918 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAG1P15918 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAG1P15918 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAG1P15918 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAG1P15918 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAG1P15918 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAG1P15918 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAG1P15918 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAG1P15918 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAG1P15918 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RAG1P15918 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAG1P15918 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAG1P15918 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAG1P15918 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAG1P15918 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAG1P15918 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RAG1P15918 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAG1P15918 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAG1P15918 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAG1P15918 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAG1P15918 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAG1P15918 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAG1P15918 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RAG1P15918 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms