Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNNT1P13805 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNNT1P13805 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNNT1P13805 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TNNT1P13805 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNNT1P13805 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNNT1P13805 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TNNT1P13805 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNNT1P13805 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNNT1P13805 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNNT1P13805 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNT1P13805 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNT1P13805 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNT1P13805 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNNT1P13805 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNNT1P13805 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNNT1P13805 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNNT1P13805 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNNT1P13805 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TNNT1P13805 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TNNT1P13805 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNNT1P13805 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNNT1P13805 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNNT1P13805 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNNT1P13805 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNNT1P13805 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNNT1P13805 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNNT1P13805 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNNT1P13805 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNNT1P13805 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNNT1P13805 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNNT1P13805 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNNT1P13805 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNNT1P13805 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNNT1P13805 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNNT1P13805 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNNT1P13805 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNNT1P13805 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TNNT1P13805 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNNT1P13805 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNNT1P13805 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TNNT1P13805 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNNT1P13805 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNNT1P13805 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNNT1P13805 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNNT1P13805 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TNNT1P13805 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNNT1P13805 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNNT1P13805 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNNT1P13805 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNNT1P13805 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNNT1P13805 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNNT1P13805 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNNT1P13805 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNNT1P13805 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNNT1P13805 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNNT1P13805 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNNT1P13805 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNNT1P13805 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNNT1P13805 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNNT1P13805 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNNT1P13805 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
TNNT1P13805 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TNNT1P13805 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TNNT1P13805 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TNNT1P13805 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNNT1P13805 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNNT1P13805 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNNT1P13805 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNNT1P13805 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNNT1P13805 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNNT1P13805 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNNT1P13805 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNNT1P13805 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNNT1P13805 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNNT1P13805 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNNT1P13805 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNNT1P13805 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNNT1P13805 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNNT1P13805 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNNT1P13805 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNNT1P13805 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TNNT1P13805 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNNT1P13805 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNNT1P13805 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNNT1P13805 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNNT1P13805 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNNT1P13805 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNNT1P13805 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNNT1P13805 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNNT1P13805 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNNT1P13805 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNNT1P13805 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNNT1P13805 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNNT1P13805 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNNT1P13805 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNNT1P13805 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNNT1P13805 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNNT1P13805 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNNT1P13805 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms