Protein–RNA interactions for Protein: P13637

ATP1A3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A3P13637 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP1A3P13637 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP1A3P13637 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP1A3P13637 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP1A3P13637 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP1A3P13637 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP1A3P13637 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP1A3P13637 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP1A3P13637 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP1A3P13637 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP1A3P13637 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP1A3P13637 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP1A3P13637 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP1A3P13637 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP1A3P13637 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP1A3P13637 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP1A3P13637 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP1A3P13637 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP1A3P13637 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP1A3P13637 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP1A3P13637 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP1A3P13637 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP1A3P13637 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP1A3P13637 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP1A3P13637 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP1A3P13637 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP1A3P13637 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP1A3P13637 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP1A3P13637 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP1A3P13637 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP1A3P13637 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP1A3P13637 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP1A3P13637 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP1A3P13637 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATP1A3P13637 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATP1A3P13637 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP1A3P13637 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP1A3P13637 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP1A3P13637 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP1A3P13637 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP1A3P13637 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP1A3P13637 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP1A3P13637 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP1A3P13637 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP1A3P13637 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP1A3P13637 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP1A3P13637 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP1A3P13637 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP1A3P13637 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP1A3P13637 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP1A3P13637 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP1A3P13637 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP1A3P13637 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP1A3P13637 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP1A3P13637 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP1A3P13637 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP1A3P13637 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP1A3P13637 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATP1A3P13637 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP1A3P13637 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP1A3P13637 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP1A3P13637 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP1A3P13637 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP1A3P13637 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP1A3P13637 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP1A3P13637 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP1A3P13637 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP1A3P13637 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP1A3P13637 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP1A3P13637 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP1A3P13637 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP1A3P13637 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP1A3P13637 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP1A3P13637 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP1A3P13637 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP1A3P13637 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP1A3P13637 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP1A3P13637 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATP1A3P13637 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ATP1A3P13637 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ATP1A3P13637 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP1A3P13637 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP1A3P13637 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP1A3P13637 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP1A3P13637 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP1A3P13637 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP1A3P13637 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP1A3P13637 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP1A3P13637 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP1A3P13637 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP1A3P13637 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP1A3P13637 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP1A3P13637 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP1A3P13637 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP1A3P13637 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP1A3P13637 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP1A3P13637 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP1A3P13637 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP1A3P13637 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP1A3P13637 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms