Protein–RNA interactions for Protein: P13385

TDGF1, Teratocarcinoma-derived growth factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDGF1P13385 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TDGF1P13385 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TDGF1P13385 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TDGF1P13385 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TDGF1P13385 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TDGF1P13385 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TDGF1P13385 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TDGF1P13385 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TDGF1P13385 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TDGF1P13385 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TDGF1P13385 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TDGF1P13385 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TDGF1P13385 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TDGF1P13385 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TDGF1P13385 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TDGF1P13385 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TDGF1P13385 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TDGF1P13385 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TDGF1P13385 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TDGF1P13385 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TDGF1P13385 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TDGF1P13385 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TDGF1P13385 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TDGF1P13385 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TDGF1P13385 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TDGF1P13385 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TDGF1P13385 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TDGF1P13385 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TDGF1P13385 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TDGF1P13385 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TDGF1P13385 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TDGF1P13385 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TDGF1P13385 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TDGF1P13385 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TDGF1P13385 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TDGF1P13385 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TDGF1P13385 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TDGF1P13385 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TDGF1P13385 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TDGF1P13385 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TDGF1P13385 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TDGF1P13385 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TDGF1P13385 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TDGF1P13385 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TDGF1P13385 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TDGF1P13385 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TDGF1P13385 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TDGF1P13385 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TDGF1P13385 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TDGF1P13385 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TDGF1P13385 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TDGF1P13385 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TDGF1P13385 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TDGF1P13385 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TDGF1P13385 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TDGF1P13385 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TDGF1P13385 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TDGF1P13385 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TDGF1P13385 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TDGF1P13385 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TDGF1P13385 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TDGF1P13385 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TDGF1P13385 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TDGF1P13385 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TDGF1P13385 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TDGF1P13385 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TDGF1P13385 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TDGF1P13385 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TDGF1P13385 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TDGF1P13385 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TDGF1P13385 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TDGF1P13385 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TDGF1P13385 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TDGF1P13385 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TDGF1P13385 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TDGF1P13385 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TDGF1P13385 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TDGF1P13385 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TDGF1P13385 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TDGF1P13385 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TDGF1P13385 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TDGF1P13385 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TDGF1P13385 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TDGF1P13385 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TDGF1P13385 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TDGF1P13385 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TDGF1P13385 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TDGF1P13385 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TDGF1P13385 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TDGF1P13385 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TDGF1P13385 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TDGF1P13385 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TDGF1P13385 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TDGF1P13385 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TDGF1P13385 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TDGF1P13385 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TDGF1P13385 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TDGF1P13385 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TDGF1P13385 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TDGF1P13385 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms