Protein–RNA interactions for Protein: P11441

UBL4A, Ubiquitin-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4AP11441 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBL4AP11441 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBL4AP11441 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBL4AP11441 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBL4AP11441 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBL4AP11441 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBL4AP11441 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBL4AP11441 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBL4AP11441 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBL4AP11441 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBL4AP11441 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBL4AP11441 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBL4AP11441 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBL4AP11441 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBL4AP11441 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBL4AP11441 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBL4AP11441 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBL4AP11441 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBL4AP11441 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBL4AP11441 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBL4AP11441 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBL4AP11441 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBL4AP11441 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBL4AP11441 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBL4AP11441 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBL4AP11441 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBL4AP11441 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBL4AP11441 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBL4AP11441 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBL4AP11441 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBL4AP11441 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBL4AP11441 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBL4AP11441 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBL4AP11441 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBL4AP11441 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBL4AP11441 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBL4AP11441 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBL4AP11441 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBL4AP11441 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBL4AP11441 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBL4AP11441 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBL4AP11441 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBL4AP11441 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBL4AP11441 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBL4AP11441 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBL4AP11441 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBL4AP11441 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBL4AP11441 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBL4AP11441 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBL4AP11441 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBL4AP11441 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBL4AP11441 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
UBL4AP11441 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBL4AP11441 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBL4AP11441 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBL4AP11441 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBL4AP11441 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBL4AP11441 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBL4AP11441 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBL4AP11441 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBL4AP11441 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBL4AP11441 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBL4AP11441 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBL4AP11441 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBL4AP11441 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBL4AP11441 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBL4AP11441 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBL4AP11441 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBL4AP11441 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBL4AP11441 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBL4AP11441 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBL4AP11441 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBL4AP11441 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBL4AP11441 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBL4AP11441 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBL4AP11441 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBL4AP11441 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBL4AP11441 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBL4AP11441 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBL4AP11441 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBL4AP11441 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBL4AP11441 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBL4AP11441 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
UBL4AP11441 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
UBL4AP11441 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
UBL4AP11441 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBL4AP11441 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBL4AP11441 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBL4AP11441 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBL4AP11441 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBL4AP11441 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBL4AP11441 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBL4AP11441 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBL4AP11441 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBL4AP11441 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBL4AP11441 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBL4AP11441 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBL4AP11441 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBL4AP11441 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBL4AP11441 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.9 ms