Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC175P0C221 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC175P0C221 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC175P0C221 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC175P0C221 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC175P0C221 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC175P0C221 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC175P0C221 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC175P0C221 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC175P0C221 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC175P0C221 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC175P0C221 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC175P0C221 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC175P0C221 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC175P0C221 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC175P0C221 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC175P0C221 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC175P0C221 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC175P0C221 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC175P0C221 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC175P0C221 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC175P0C221 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC175P0C221 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC175P0C221 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC175P0C221 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC175P0C221 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC175P0C221 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC175P0C221 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC175P0C221 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC175P0C221 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC175P0C221 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC175P0C221 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC175P0C221 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC175P0C221 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC175P0C221 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC175P0C221 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC175P0C221 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC175P0C221 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC175P0C221 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC175P0C221 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC175P0C221 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC175P0C221 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC175P0C221 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC175P0C221 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC175P0C221 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC175P0C221 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC175P0C221 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC175P0C221 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC175P0C221 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC175P0C221 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC175P0C221 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC175P0C221 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC175P0C221 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC175P0C221 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC175P0C221 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC175P0C221 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC175P0C221 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC175P0C221 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC175P0C221 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC175P0C221 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC175P0C221 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC175P0C221 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC175P0C221 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC175P0C221 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC175P0C221 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC175P0C221 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC175P0C221 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC175P0C221 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC175P0C221 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC175P0C221 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC175P0C221 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC175P0C221 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC175P0C221 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC175P0C221 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC175P0C221 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC175P0C221 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC175P0C221 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC175P0C221 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC175P0C221 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC175P0C221 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC175P0C221 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC175P0C221 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC175P0C221 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC175P0C221 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC175P0C221 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC175P0C221 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC175P0C221 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC175P0C221 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC175P0C221 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC175P0C221 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC175P0C221 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC175P0C221 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC175P0C221 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC175P0C221 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC175P0C221 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC175P0C221 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC175P0C221 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC175P0C221 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC175P0C221 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC175P0C221 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms