Protein–RNA interactions for Protein: P09455

RBP1, Retinol-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP1P09455 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBP1P09455 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBP1P09455 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBP1P09455 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBP1P09455 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBP1P09455 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBP1P09455 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBP1P09455 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBP1P09455 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBP1P09455 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBP1P09455 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBP1P09455 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBP1P09455 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBP1P09455 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBP1P09455 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBP1P09455 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBP1P09455 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBP1P09455 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBP1P09455 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBP1P09455 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBP1P09455 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBP1P09455 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBP1P09455 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RBP1P09455 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RBP1P09455 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RBP1P09455 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBP1P09455 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBP1P09455 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RBP1P09455 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBP1P09455 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBP1P09455 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBP1P09455 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBP1P09455 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBP1P09455 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBP1P09455 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RBP1P09455 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBP1P09455 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RBP1P09455 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RBP1P09455 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBP1P09455 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBP1P09455 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBP1P09455 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBP1P09455 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBP1P09455 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBP1P09455 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBP1P09455 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBP1P09455 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBP1P09455 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBP1P09455 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBP1P09455 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBP1P09455 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBP1P09455 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBP1P09455 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBP1P09455 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBP1P09455 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBP1P09455 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBP1P09455 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBP1P09455 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBP1P09455 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBP1P09455 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBP1P09455 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBP1P09455 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBP1P09455 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBP1P09455 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RBP1P09455 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBP1P09455 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RBP1P09455 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBP1P09455 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBP1P09455 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBP1P09455 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBP1P09455 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBP1P09455 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBP1P09455 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBP1P09455 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBP1P09455 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBP1P09455 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBP1P09455 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBP1P09455 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBP1P09455 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBP1P09455 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RBP1P09455 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RBP1P09455 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RBP1P09455 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RBP1P09455 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RBP1P09455 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RBP1P09455 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
RBP1P09455 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBP1P09455 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBP1P09455 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBP1P09455 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RBP1P09455 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBP1P09455 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBP1P09455 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBP1P09455 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBP1P09455 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBP1P09455 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBP1P09455 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBP1P09455 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBP1P09455 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBP1P09455 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms