Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CENPBP07199 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CENPBP07199 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
CENPBP07199 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CENPBP07199 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CENPBP07199 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CENPBP07199 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CENPBP07199 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CENPBP07199 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CENPBP07199 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CENPBP07199 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CENPBP07199 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CENPBP07199 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CENPBP07199 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CENPBP07199 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CENPBP07199 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CENPBP07199 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CENPBP07199 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CENPBP07199 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CENPBP07199 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CENPBP07199 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CENPBP07199 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CENPBP07199 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CENPBP07199 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CENPBP07199 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
CENPBP07199 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
CENPBP07199 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CENPBP07199 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CENPBP07199 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CENPBP07199 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CENPBP07199 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CENPBP07199 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CENPBP07199 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CENPBP07199 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CENPBP07199 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CENPBP07199 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CENPBP07199 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CENPBP07199 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CENPBP07199 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CENPBP07199 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CENPBP07199 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CENPBP07199 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CENPBP07199 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CENPBP07199 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CENPBP07199 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CENPBP07199 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CENPBP07199 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
CENPBP07199 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CENPBP07199 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CENPBP07199 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CENPBP07199 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CENPBP07199 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CENPBP07199 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
CENPBP07199 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CENPBP07199 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CENPBP07199 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CENPBP07199 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CENPBP07199 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CENPBP07199 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CENPBP07199 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CENPBP07199 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CENPBP07199 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CENPBP07199 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CENPBP07199 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CENPBP07199 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CENPBP07199 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CENPBP07199 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CENPBP07199 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CENPBP07199 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CENPBP07199 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CENPBP07199 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CENPBP07199 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CENPBP07199 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CENPBP07199 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CENPBP07199 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CENPBP07199 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CENPBP07199 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CENPBP07199 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CENPBP07199 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CENPBP07199 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CENPBP07199 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CENPBP07199 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CENPBP07199 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CENPBP07199 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CENPBP07199 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CENPBP07199 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CENPBP07199 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CENPBP07199 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CENPBP07199 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CENPBP07199 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CENPBP07199 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CENPBP07199 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CENPBP07199 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CENPBP07199 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CENPBP07199 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CENPBP07199 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CENPBP07199 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CENPBP07199 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
CENPBP07199 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CENPBP07199 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms