Protein–RNA interactions for Protein: P01350

GAST, Gastrin, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GASTP01350 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GASTP01350 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GASTP01350 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GASTP01350 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GASTP01350 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GASTP01350 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GASTP01350 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GASTP01350 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GASTP01350 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GASTP01350 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GASTP01350 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GASTP01350 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GASTP01350 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GASTP01350 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GASTP01350 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GASTP01350 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GASTP01350 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GASTP01350 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GASTP01350 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GASTP01350 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GASTP01350 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GASTP01350 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GASTP01350 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GASTP01350 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GASTP01350 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GASTP01350 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GASTP01350 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GASTP01350 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GASTP01350 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GASTP01350 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GASTP01350 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GASTP01350 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GASTP01350 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GASTP01350 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GASTP01350 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GASTP01350 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GASTP01350 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GASTP01350 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GASTP01350 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GASTP01350 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GASTP01350 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GASTP01350 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GASTP01350 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GASTP01350 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GASTP01350 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GASTP01350 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GASTP01350 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GASTP01350 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GASTP01350 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GASTP01350 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GASTP01350 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GASTP01350 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GASTP01350 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GASTP01350 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GASTP01350 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GASTP01350 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GASTP01350 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GASTP01350 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GASTP01350 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GASTP01350 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GASTP01350 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GASTP01350 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GASTP01350 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GASTP01350 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GASTP01350 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GASTP01350 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GASTP01350 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GASTP01350 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GASTP01350 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GASTP01350 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GASTP01350 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GASTP01350 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GASTP01350 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GASTP01350 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GASTP01350 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GASTP01350 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GASTP01350 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GASTP01350 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GASTP01350 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GASTP01350 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GASTP01350 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GASTP01350 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GASTP01350 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GASTP01350 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GASTP01350 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GASTP01350 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GASTP01350 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GASTP01350 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GASTP01350 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GASTP01350 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GASTP01350 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GASTP01350 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GASTP01350 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GASTP01350 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GASTP01350 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GASTP01350 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GASTP01350 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GASTP01350 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GASTP01350 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GASTP01350 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms