Protein–RNA interactions for Protein: O95260

ATE1, Arginyl-tRNA--protein transferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATE1O95260 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATE1O95260 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATE1O95260 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATE1O95260 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATE1O95260 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATE1O95260 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATE1O95260 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATE1O95260 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATE1O95260 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATE1O95260 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATE1O95260 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATE1O95260 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATE1O95260 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATE1O95260 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATE1O95260 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATE1O95260 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATE1O95260 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATE1O95260 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATE1O95260 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATE1O95260 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATE1O95260 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATE1O95260 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATE1O95260 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATE1O95260 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATE1O95260 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATE1O95260 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATE1O95260 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATE1O95260 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATE1O95260 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATE1O95260 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATE1O95260 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATE1O95260 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATE1O95260 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATE1O95260 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATE1O95260 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATE1O95260 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATE1O95260 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATE1O95260 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATE1O95260 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATE1O95260 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATE1O95260 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATE1O95260 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATE1O95260 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATE1O95260 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATE1O95260 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATE1O95260 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATE1O95260 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATE1O95260 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATE1O95260 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATE1O95260 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATE1O95260 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATE1O95260 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATE1O95260 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATE1O95260 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATE1O95260 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATE1O95260 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATE1O95260 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATE1O95260 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATE1O95260 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATE1O95260 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATE1O95260 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATE1O95260 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATE1O95260 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATE1O95260 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATE1O95260 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATE1O95260 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATE1O95260 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATE1O95260 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATE1O95260 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATE1O95260 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATE1O95260 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATE1O95260 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATE1O95260 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATE1O95260 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATE1O95260 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATE1O95260 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATE1O95260 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATE1O95260 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATE1O95260 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATE1O95260 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATE1O95260 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATE1O95260 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATE1O95260 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATE1O95260 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATE1O95260 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATE1O95260 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATE1O95260 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATE1O95260 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATE1O95260 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATE1O95260 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATE1O95260 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATE1O95260 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATE1O95260 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATE1O95260 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATE1O95260 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ATE1O95260 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATE1O95260 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATE1O95260 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATE1O95260 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATE1O95260 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms