Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLSTN1O94985 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLSTN1O94985 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLSTN1O94985 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLSTN1O94985 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLSTN1O94985 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLSTN1O94985 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLSTN1O94985 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLSTN1O94985 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLSTN1O94985 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLSTN1O94985 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLSTN1O94985 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLSTN1O94985 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLSTN1O94985 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLSTN1O94985 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLSTN1O94985 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLSTN1O94985 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLSTN1O94985 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLSTN1O94985 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLSTN1O94985 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLSTN1O94985 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLSTN1O94985 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLSTN1O94985 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLSTN1O94985 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLSTN1O94985 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CLSTN1O94985 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLSTN1O94985 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLSTN1O94985 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLSTN1O94985 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLSTN1O94985 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLSTN1O94985 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLSTN1O94985 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLSTN1O94985 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLSTN1O94985 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CLSTN1O94985 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLSTN1O94985 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLSTN1O94985 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLSTN1O94985 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLSTN1O94985 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLSTN1O94985 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLSTN1O94985 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLSTN1O94985 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLSTN1O94985 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLSTN1O94985 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLSTN1O94985 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLSTN1O94985 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLSTN1O94985 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLSTN1O94985 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLSTN1O94985 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLSTN1O94985 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CLSTN1O94985 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLSTN1O94985 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLSTN1O94985 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLSTN1O94985 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLSTN1O94985 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLSTN1O94985 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLSTN1O94985 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLSTN1O94985 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CLSTN1O94985 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLSTN1O94985 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLSTN1O94985 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLSTN1O94985 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLSTN1O94985 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLSTN1O94985 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLSTN1O94985 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLSTN1O94985 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLSTN1O94985 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLSTN1O94985 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLSTN1O94985 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLSTN1O94985 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLSTN1O94985 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CLSTN1O94985 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLSTN1O94985 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLSTN1O94985 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLSTN1O94985 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLSTN1O94985 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLSTN1O94985 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CLSTN1O94985 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLSTN1O94985 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CLSTN1O94985 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLSTN1O94985 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CLSTN1O94985 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CLSTN1O94985 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CLSTN1O94985 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLSTN1O94985 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLSTN1O94985 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLSTN1O94985 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLSTN1O94985 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLSTN1O94985 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLSTN1O94985 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLSTN1O94985 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLSTN1O94985 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLSTN1O94985 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLSTN1O94985 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLSTN1O94985 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLSTN1O94985 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLSTN1O94985 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLSTN1O94985 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLSTN1O94985 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLSTN1O94985 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms