Protein–RNA interactions for Protein: O94782

USP1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP1O94782 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP1O94782 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP1O94782 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP1O94782 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP1O94782 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP1O94782 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP1O94782 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP1O94782 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP1O94782 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP1O94782 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP1O94782 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP1O94782 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP1O94782 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP1O94782 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP1O94782 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP1O94782 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP1O94782 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP1O94782 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP1O94782 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP1O94782 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP1O94782 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP1O94782 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP1O94782 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP1O94782 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP1O94782 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP1O94782 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP1O94782 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP1O94782 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP1O94782 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP1O94782 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP1O94782 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP1O94782 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP1O94782 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP1O94782 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP1O94782 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP1O94782 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP1O94782 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP1O94782 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP1O94782 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP1O94782 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP1O94782 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP1O94782 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP1O94782 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP1O94782 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP1O94782 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP1O94782 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP1O94782 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP1O94782 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP1O94782 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP1O94782 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP1O94782 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP1O94782 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP1O94782 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP1O94782 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP1O94782 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP1O94782 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
USP1O94782 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP1O94782 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP1O94782 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP1O94782 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP1O94782 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP1O94782 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP1O94782 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP1O94782 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP1O94782 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP1O94782 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP1O94782 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP1O94782 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP1O94782 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP1O94782 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP1O94782 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP1O94782 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP1O94782 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP1O94782 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP1O94782 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP1O94782 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
USP1O94782 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP1O94782 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP1O94782 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP1O94782 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP1O94782 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP1O94782 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP1O94782 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP1O94782 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP1O94782 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP1O94782 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
USP1O94782 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP1O94782 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP1O94782 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP1O94782 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP1O94782 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP1O94782 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP1O94782 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP1O94782 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP1O94782 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP1O94782 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP1O94782 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP1O94782 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP1O94782 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP1O94782 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms