Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ECM2O94769 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ECM2O94769 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ECM2O94769 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ECM2O94769 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ECM2O94769 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ECM2O94769 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ECM2O94769 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ECM2O94769 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ECM2O94769 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ECM2O94769 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ECM2O94769 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ECM2O94769 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ECM2O94769 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ECM2O94769 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ECM2O94769 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ECM2O94769 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ECM2O94769 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ECM2O94769 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ECM2O94769 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ECM2O94769 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ECM2O94769 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ECM2O94769 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ECM2O94769 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ECM2O94769 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ECM2O94769 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ECM2O94769 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ECM2O94769 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ECM2O94769 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ECM2O94769 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ECM2O94769 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ECM2O94769 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ECM2O94769 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ECM2O94769 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ECM2O94769 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ECM2O94769 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ECM2O94769 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ECM2O94769 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ECM2O94769 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ECM2O94769 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
ECM2O94769 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ECM2O94769 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ECM2O94769 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ECM2O94769 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ECM2O94769 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
ECM2O94769 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ECM2O94769 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ECM2O94769 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ECM2O94769 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ECM2O94769 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
ECM2O94769 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ECM2O94769 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ECM2O94769 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
ECM2O94769 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ECM2O94769 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ECM2O94769 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ECM2O94769 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ECM2O94769 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ECM2O94769 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ECM2O94769 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ECM2O94769 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ECM2O94769 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ECM2O94769 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ECM2O94769 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ECM2O94769 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ECM2O94769 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ECM2O94769 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ECM2O94769 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ECM2O94769 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ECM2O94769 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ECM2O94769 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ECM2O94769 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ECM2O94769 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ECM2O94769 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ECM2O94769 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ECM2O94769 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ECM2O94769 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ECM2O94769 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ECM2O94769 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ECM2O94769 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ECM2O94769 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ECM2O94769 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ECM2O94769 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ECM2O94769 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ECM2O94769 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ECM2O94769 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ECM2O94769 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ECM2O94769 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ECM2O94769 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ECM2O94769 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ECM2O94769 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ECM2O94769 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ECM2O94769 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ECM2O94769 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ECM2O94769 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ECM2O94769 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ECM2O94769 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ECM2O94769 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ECM2O94769 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ECM2O94769 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms