Protein–RNA interactions for Protein: O75956

CDK2AP2, Cyclin-dependent kinase 2-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK2AP2O75956 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK2AP2O75956 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK2AP2O75956 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK2AP2O75956 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK2AP2O75956 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CDK2AP2O75956 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK2AP2O75956 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK2AP2O75956 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK2AP2O75956 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK2AP2O75956 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK2AP2O75956 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK2AP2O75956 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK2AP2O75956 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK2AP2O75956 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK2AP2O75956 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK2AP2O75956 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK2AP2O75956 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK2AP2O75956 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK2AP2O75956 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK2AP2O75956 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK2AP2O75956 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK2AP2O75956 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK2AP2O75956 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK2AP2O75956 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK2AP2O75956 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK2AP2O75956 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK2AP2O75956 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK2AP2O75956 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK2AP2O75956 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK2AP2O75956 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK2AP2O75956 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK2AP2O75956 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK2AP2O75956 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK2AP2O75956 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK2AP2O75956 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK2AP2O75956 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK2AP2O75956 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK2AP2O75956 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK2AP2O75956 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK2AP2O75956 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK2AP2O75956 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK2AP2O75956 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK2AP2O75956 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK2AP2O75956 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK2AP2O75956 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK2AP2O75956 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK2AP2O75956 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK2AP2O75956 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK2AP2O75956 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK2AP2O75956 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK2AP2O75956 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK2AP2O75956 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK2AP2O75956 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK2AP2O75956 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK2AP2O75956 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK2AP2O75956 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK2AP2O75956 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK2AP2O75956 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK2AP2O75956 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK2AP2O75956 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK2AP2O75956 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK2AP2O75956 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK2AP2O75956 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK2AP2O75956 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK2AP2O75956 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK2AP2O75956 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK2AP2O75956 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK2AP2O75956 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK2AP2O75956 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK2AP2O75956 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK2AP2O75956 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK2AP2O75956 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK2AP2O75956 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK2AP2O75956 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK2AP2O75956 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK2AP2O75956 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK2AP2O75956 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK2AP2O75956 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK2AP2O75956 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK2AP2O75956 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK2AP2O75956 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK2AP2O75956 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK2AP2O75956 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK2AP2O75956 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK2AP2O75956 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK2AP2O75956 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK2AP2O75956 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK2AP2O75956 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK2AP2O75956 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK2AP2O75956 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK2AP2O75956 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK2AP2O75956 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK2AP2O75956 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK2AP2O75956 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK2AP2O75956 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK2AP2O75956 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK2AP2O75956 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK2AP2O75956 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK2AP2O75956 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK2AP2O75956 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms