Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCNKO75909 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCNKO75909 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCNKO75909 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCNKO75909 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCNKO75909 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCNKO75909 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCNKO75909 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCNKO75909 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCNKO75909 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCNKO75909 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCNKO75909 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCNKO75909 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCNKO75909 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCNKO75909 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCNKO75909 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCNKO75909 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCNKO75909 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCNKO75909 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCNKO75909 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCNKO75909 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCNKO75909 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCNKO75909 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCNKO75909 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCNKO75909 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCNKO75909 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCNKO75909 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCNKO75909 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCNKO75909 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCNKO75909 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCNKO75909 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCNKO75909 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCNKO75909 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCNKO75909 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCNKO75909 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCNKO75909 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCNKO75909 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCNKO75909 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCNKO75909 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCNKO75909 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCNKO75909 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCNKO75909 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCNKO75909 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCNKO75909 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCNKO75909 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCNKO75909 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCNKO75909 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCNKO75909 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCNKO75909 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCNKO75909 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCNKO75909 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCNKO75909 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCNKO75909 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCNKO75909 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCNKO75909 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCNKO75909 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCNKO75909 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCNKO75909 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCNKO75909 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCNKO75909 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCNKO75909 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCNKO75909 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCNKO75909 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCNKO75909 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCNKO75909 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCNKO75909 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCNKO75909 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCNKO75909 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCNKO75909 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCNKO75909 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCNKO75909 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCNKO75909 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCNKO75909 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCNKO75909 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCNKO75909 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCNKO75909 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCNKO75909 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCNKO75909 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCNKO75909 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCNKO75909 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CCNKO75909 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCNKO75909 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCNKO75909 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCNKO75909 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCNKO75909 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCNKO75909 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCNKO75909 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCNKO75909 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCNKO75909 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCNKO75909 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCNKO75909 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCNKO75909 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCNKO75909 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCNKO75909 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCNKO75909 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCNKO75909 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCNKO75909 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCNKO75909 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCNKO75909 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCNKO75909 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms