Protein–RNA interactions for Protein: O75808

CAPN15, Calpain-15, humanhuman

Predictions only

Length 1,086 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN15O75808 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CAPN15O75808 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CAPN15O75808 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CAPN15O75808 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CAPN15O75808 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CAPN15O75808 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CAPN15O75808 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CAPN15O75808 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CAPN15O75808 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CAPN15O75808 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CAPN15O75808 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CAPN15O75808 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CAPN15O75808 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CAPN15O75808 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CAPN15O75808 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CAPN15O75808 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CAPN15O75808 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CAPN15O75808 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CAPN15O75808 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CAPN15O75808 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CAPN15O75808 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CAPN15O75808 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CAPN15O75808 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CAPN15O75808 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CAPN15O75808 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CAPN15O75808 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CAPN15O75808 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CAPN15O75808 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CAPN15O75808 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CAPN15O75808 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CAPN15O75808 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CAPN15O75808 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CAPN15O75808 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CAPN15O75808 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CAPN15O75808 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CAPN15O75808 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CAPN15O75808 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CAPN15O75808 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CAPN15O75808 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CAPN15O75808 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CAPN15O75808 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CAPN15O75808 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CAPN15O75808 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CAPN15O75808 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CAPN15O75808 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CAPN15O75808 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CAPN15O75808 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CAPN15O75808 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CAPN15O75808 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CAPN15O75808 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CAPN15O75808 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CAPN15O75808 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CAPN15O75808 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CAPN15O75808 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CAPN15O75808 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CAPN15O75808 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CAPN15O75808 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CAPN15O75808 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CAPN15O75808 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CAPN15O75808 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CAPN15O75808 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CAPN15O75808 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CAPN15O75808 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CAPN15O75808 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CAPN15O75808 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CAPN15O75808 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CAPN15O75808 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CAPN15O75808 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CAPN15O75808 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CAPN15O75808 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CAPN15O75808 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CAPN15O75808 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CAPN15O75808 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CAPN15O75808 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CAPN15O75808 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CAPN15O75808 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CAPN15O75808 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CAPN15O75808 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CAPN15O75808 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CAPN15O75808 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CAPN15O75808 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CAPN15O75808 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CAPN15O75808 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CAPN15O75808 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CAPN15O75808 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CAPN15O75808 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CAPN15O75808 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CAPN15O75808 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CAPN15O75808 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CAPN15O75808 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CAPN15O75808 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CAPN15O75808 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CAPN15O75808 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CAPN15O75808 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CAPN15O75808 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CAPN15O75808 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CAPN15O75808 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CAPN15O75808 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CAPN15O75808 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CAPN15O75808 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms