Protein–RNA interactions for Protein: O75764

TCEA3, Transcription elongation factor A protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA3O75764 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TCEA3O75764 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TCEA3O75764 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TCEA3O75764 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TCEA3O75764 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TCEA3O75764 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TCEA3O75764 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCEA3O75764 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCEA3O75764 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCEA3O75764 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TCEA3O75764 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCEA3O75764 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCEA3O75764 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TCEA3O75764 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCEA3O75764 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCEA3O75764 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCEA3O75764 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCEA3O75764 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCEA3O75764 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCEA3O75764 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCEA3O75764 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCEA3O75764 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TCEA3O75764 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TCEA3O75764 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TCEA3O75764 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TCEA3O75764 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TCEA3O75764 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TCEA3O75764 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCEA3O75764 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCEA3O75764 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCEA3O75764 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TCEA3O75764 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TCEA3O75764 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TCEA3O75764 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
TCEA3O75764 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TCEA3O75764 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCEA3O75764 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCEA3O75764 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TCEA3O75764 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCEA3O75764 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCEA3O75764 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TCEA3O75764 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCEA3O75764 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCEA3O75764 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCEA3O75764 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCEA3O75764 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCEA3O75764 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCEA3O75764 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCEA3O75764 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCEA3O75764 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCEA3O75764 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCEA3O75764 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCEA3O75764 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCEA3O75764 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCEA3O75764 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCEA3O75764 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCEA3O75764 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCEA3O75764 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCEA3O75764 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCEA3O75764 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCEA3O75764 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCEA3O75764 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCEA3O75764 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCEA3O75764 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TCEA3O75764 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCEA3O75764 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCEA3O75764 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCEA3O75764 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCEA3O75764 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCEA3O75764 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCEA3O75764 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCEA3O75764 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCEA3O75764 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCEA3O75764 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TCEA3O75764 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCEA3O75764 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCEA3O75764 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCEA3O75764 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCEA3O75764 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCEA3O75764 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCEA3O75764 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCEA3O75764 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCEA3O75764 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCEA3O75764 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCEA3O75764 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCEA3O75764 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCEA3O75764 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCEA3O75764 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCEA3O75764 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCEA3O75764 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCEA3O75764 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCEA3O75764 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCEA3O75764 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCEA3O75764 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TCEA3O75764 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCEA3O75764 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCEA3O75764 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TCEA3O75764 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCEA3O75764 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCEA3O75764 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms