Protein–RNA interactions for Protein: O75531

BANF1, Barrier-to-autointegration factor, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BANF1O75531 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BANF1O75531 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BANF1O75531 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BANF1O75531 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BANF1O75531 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BANF1O75531 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BANF1O75531 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
BANF1O75531 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BANF1O75531 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BANF1O75531 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BANF1O75531 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BANF1O75531 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BANF1O75531 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BANF1O75531 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BANF1O75531 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BANF1O75531 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BANF1O75531 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BANF1O75531 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BANF1O75531 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BANF1O75531 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BANF1O75531 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BANF1O75531 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BANF1O75531 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BANF1O75531 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BANF1O75531 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BANF1O75531 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BANF1O75531 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BANF1O75531 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BANF1O75531 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BANF1O75531 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BANF1O75531 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BANF1O75531 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BANF1O75531 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BANF1O75531 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
BANF1O75531 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BANF1O75531 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BANF1O75531 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BANF1O75531 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BANF1O75531 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BANF1O75531 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BANF1O75531 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BANF1O75531 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BANF1O75531 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BANF1O75531 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BANF1O75531 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BANF1O75531 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BANF1O75531 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BANF1O75531 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BANF1O75531 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BANF1O75531 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BANF1O75531 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BANF1O75531 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
BANF1O75531 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
BANF1O75531 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
BANF1O75531 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
BANF1O75531 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
BANF1O75531 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BANF1O75531 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BANF1O75531 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BANF1O75531 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BANF1O75531 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BANF1O75531 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
BANF1O75531 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
BANF1O75531 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
BANF1O75531 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
BANF1O75531 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
BANF1O75531 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
BANF1O75531 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
BANF1O75531 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
BANF1O75531 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
BANF1O75531 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BANF1O75531 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BANF1O75531 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BANF1O75531 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BANF1O75531 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BANF1O75531 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BANF1O75531 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BANF1O75531 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BANF1O75531 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BANF1O75531 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BANF1O75531 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BANF1O75531 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BANF1O75531 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BANF1O75531 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BANF1O75531 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
BANF1O75531 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
BANF1O75531 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BANF1O75531 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BANF1O75531 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BANF1O75531 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BANF1O75531 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BANF1O75531 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
BANF1O75531 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
BANF1O75531 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
BANF1O75531 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BANF1O75531 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BANF1O75531 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BANF1O75531 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BANF1O75531 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BANF1O75531 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms