Protein–RNA interactions for Protein: O75487

GPC4, Glypican-4, humanhuman

Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC4O75487 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPC4O75487 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPC4O75487 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GPC4O75487 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPC4O75487 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPC4O75487 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPC4O75487 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPC4O75487 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GPC4O75487 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPC4O75487 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPC4O75487 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPC4O75487 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPC4O75487 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPC4O75487 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPC4O75487 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPC4O75487 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPC4O75487 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPC4O75487 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPC4O75487 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPC4O75487 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPC4O75487 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPC4O75487 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPC4O75487 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPC4O75487 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPC4O75487 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPC4O75487 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPC4O75487 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPC4O75487 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPC4O75487 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPC4O75487 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPC4O75487 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPC4O75487 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPC4O75487 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPC4O75487 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPC4O75487 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPC4O75487 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPC4O75487 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPC4O75487 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPC4O75487 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPC4O75487 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GPC4O75487 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPC4O75487 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPC4O75487 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPC4O75487 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPC4O75487 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPC4O75487 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPC4O75487 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPC4O75487 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPC4O75487 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPC4O75487 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPC4O75487 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPC4O75487 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPC4O75487 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPC4O75487 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPC4O75487 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPC4O75487 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPC4O75487 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPC4O75487 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPC4O75487 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPC4O75487 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPC4O75487 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPC4O75487 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPC4O75487 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPC4O75487 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPC4O75487 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPC4O75487 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPC4O75487 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPC4O75487 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPC4O75487 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPC4O75487 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPC4O75487 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPC4O75487 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPC4O75487 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPC4O75487 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPC4O75487 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPC4O75487 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GPC4O75487 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPC4O75487 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPC4O75487 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPC4O75487 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GPC4O75487 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPC4O75487 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPC4O75487 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPC4O75487 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPC4O75487 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPC4O75487 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPC4O75487 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPC4O75487 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPC4O75487 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPC4O75487 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPC4O75487 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPC4O75487 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPC4O75487 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPC4O75487 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GPC4O75487 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPC4O75487 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPC4O75487 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPC4O75487 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPC4O75487 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPC4O75487 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms