Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
E2F6O75461 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
E2F6O75461 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
E2F6O75461 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
E2F6O75461 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
E2F6O75461 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
E2F6O75461 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
E2F6O75461 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
E2F6O75461 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
E2F6O75461 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
E2F6O75461 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
E2F6O75461 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
E2F6O75461 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
E2F6O75461 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
E2F6O75461 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
E2F6O75461 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
E2F6O75461 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
E2F6O75461 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
E2F6O75461 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
E2F6O75461 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
E2F6O75461 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
E2F6O75461 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
E2F6O75461 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
E2F6O75461 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
E2F6O75461 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
E2F6O75461 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
E2F6O75461 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
E2F6O75461 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
E2F6O75461 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
E2F6O75461 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
E2F6O75461 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
E2F6O75461 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
E2F6O75461 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
E2F6O75461 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
E2F6O75461 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
E2F6O75461 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
E2F6O75461 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
E2F6O75461 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
E2F6O75461 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
E2F6O75461 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
E2F6O75461 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
E2F6O75461 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E2F6O75461 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
E2F6O75461 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E2F6O75461 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E2F6O75461 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
E2F6O75461 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E2F6O75461 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
E2F6O75461 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E2F6O75461 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
E2F6O75461 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
E2F6O75461 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
E2F6O75461 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
E2F6O75461 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
E2F6O75461 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
E2F6O75461 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
E2F6O75461 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
E2F6O75461 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
E2F6O75461 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
E2F6O75461 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
E2F6O75461 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
E2F6O75461 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
E2F6O75461 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
E2F6O75461 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
E2F6O75461 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
E2F6O75461 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
E2F6O75461 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
E2F6O75461 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
E2F6O75461 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
E2F6O75461 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
E2F6O75461 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
E2F6O75461 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
E2F6O75461 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
E2F6O75461 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
E2F6O75461 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
E2F6O75461 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
E2F6O75461 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
E2F6O75461 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E2F6O75461 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E2F6O75461 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
E2F6O75461 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
E2F6O75461 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
E2F6O75461 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
E2F6O75461 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
E2F6O75461 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
E2F6O75461 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
E2F6O75461 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
E2F6O75461 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
E2F6O75461 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
E2F6O75461 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
E2F6O75461 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
E2F6O75461 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
E2F6O75461 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
E2F6O75461 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
E2F6O75461 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
E2F6O75461 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
E2F6O75461 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
E2F6O75461 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
E2F6O75461 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
E2F6O75461 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1441.5 ms