Protein–RNA interactions for Protein: O75334

PPFIA2, Liprin-alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA2O75334 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPFIA2O75334 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPFIA2O75334 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PPFIA2O75334 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PPFIA2O75334 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PPFIA2O75334 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPFIA2O75334 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPFIA2O75334 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPFIA2O75334 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPFIA2O75334 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPFIA2O75334 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPFIA2O75334 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PPFIA2O75334 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PPFIA2O75334 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PPFIA2O75334 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PPFIA2O75334 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PPFIA2O75334 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PPFIA2O75334 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PPFIA2O75334 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PPFIA2O75334 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PPFIA2O75334 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPFIA2O75334 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPFIA2O75334 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPFIA2O75334 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPFIA2O75334 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPFIA2O75334 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPFIA2O75334 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPFIA2O75334 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPFIA2O75334 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPFIA2O75334 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPFIA2O75334 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPFIA2O75334 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPFIA2O75334 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPFIA2O75334 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPFIA2O75334 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPFIA2O75334 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPFIA2O75334 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPFIA2O75334 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPFIA2O75334 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PPFIA2O75334 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PPFIA2O75334 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PPFIA2O75334 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPFIA2O75334 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPFIA2O75334 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPFIA2O75334 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPFIA2O75334 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPFIA2O75334 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPFIA2O75334 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPFIA2O75334 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PPFIA2O75334 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPFIA2O75334 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPFIA2O75334 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPFIA2O75334 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PPFIA2O75334 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPFIA2O75334 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPFIA2O75334 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPFIA2O75334 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPFIA2O75334 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPFIA2O75334 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPFIA2O75334 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPFIA2O75334 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPFIA2O75334 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPFIA2O75334 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPFIA2O75334 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPFIA2O75334 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPFIA2O75334 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPFIA2O75334 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPFIA2O75334 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPFIA2O75334 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPFIA2O75334 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PPFIA2O75334 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPFIA2O75334 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PPFIA2O75334 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PPFIA2O75334 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPFIA2O75334 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPFIA2O75334 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPFIA2O75334 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPFIA2O75334 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPFIA2O75334 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPFIA2O75334 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPFIA2O75334 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPFIA2O75334 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPFIA2O75334 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPFIA2O75334 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPFIA2O75334 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPFIA2O75334 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PPFIA2O75334 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPFIA2O75334 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPFIA2O75334 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPFIA2O75334 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPFIA2O75334 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPFIA2O75334 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPFIA2O75334 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPFIA2O75334 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPFIA2O75334 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPFIA2O75334 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPFIA2O75334 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPFIA2O75334 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPFIA2O75334 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PPFIA2O75334 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.4 ms