Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PRAMEF10O60809 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRAMEF10O60809 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PRAMEF10O60809 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEF10O60809 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEF10O60809 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEF10O60809 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEF10O60809 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEF10O60809 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEF10O60809 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEF10O60809 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEF10O60809 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRAMEF10O60809 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRAMEF10O60809 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRAMEF10O60809 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRAMEF10O60809 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRAMEF10O60809 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRAMEF10O60809 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRAMEF10O60809 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRAMEF10O60809 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRAMEF10O60809 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRAMEF10O60809 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRAMEF10O60809 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRAMEF10O60809 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRAMEF10O60809 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF10O60809 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF10O60809 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF10O60809 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF10O60809 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF10O60809 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF10O60809 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF10O60809 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF10O60809 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF10O60809 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF10O60809 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF10O60809 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF10O60809 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF10O60809 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEF10O60809 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEF10O60809 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEF10O60809 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEF10O60809 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEF10O60809 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEF10O60809 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEF10O60809 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEF10O60809 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEF10O60809 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEF10O60809 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEF10O60809 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRAMEF10O60809 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRAMEF10O60809 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRAMEF10O60809 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEF10O60809 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEF10O60809 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEF10O60809 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEF10O60809 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEF10O60809 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEF10O60809 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEF10O60809 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEF10O60809 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEF10O60809 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRAMEF10O60809 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRAMEF10O60809 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRAMEF10O60809 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRAMEF10O60809 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PRAMEF10O60809 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRAMEF10O60809 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRAMEF10O60809 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRAMEF10O60809 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRAMEF10O60809 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRAMEF10O60809 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRAMEF10O60809 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRAMEF10O60809 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRAMEF10O60809 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF10O60809 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF10O60809 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF10O60809 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF10O60809 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF10O60809 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF10O60809 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF10O60809 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF10O60809 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF10O60809 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF10O60809 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF10O60809 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF10O60809 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF10O60809 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF10O60809 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRAMEF10O60809 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRAMEF10O60809 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRAMEF10O60809 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRAMEF10O60809 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRAMEF10O60809 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRAMEF10O60809 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRAMEF10O60809 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAMEF10O60809 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAMEF10O60809 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAMEF10O60809 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAMEF10O60809 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAMEF10O60809 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
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