Protein–RNA interactions for Protein: O60359

CACNG3, Voltage-dependent calcium channel gamma-3 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG3O60359 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNG3O60359 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNG3O60359 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CACNG3O60359 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CACNG3O60359 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CACNG3O60359 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CACNG3O60359 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CACNG3O60359 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNG3O60359 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNG3O60359 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNG3O60359 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNG3O60359 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNG3O60359 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNG3O60359 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNG3O60359 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNG3O60359 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNG3O60359 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNG3O60359 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNG3O60359 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNG3O60359 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNG3O60359 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNG3O60359 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNG3O60359 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNG3O60359 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNG3O60359 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNG3O60359 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNG3O60359 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNG3O60359 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNG3O60359 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CACNG3O60359 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNG3O60359 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNG3O60359 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNG3O60359 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNG3O60359 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNG3O60359 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNG3O60359 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNG3O60359 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNG3O60359 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNG3O60359 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNG3O60359 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNG3O60359 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNG3O60359 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNG3O60359 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNG3O60359 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNG3O60359 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNG3O60359 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNG3O60359 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNG3O60359 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNG3O60359 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNG3O60359 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNG3O60359 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNG3O60359 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNG3O60359 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNG3O60359 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNG3O60359 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNG3O60359 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNG3O60359 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNG3O60359 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNG3O60359 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNG3O60359 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNG3O60359 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNG3O60359 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNG3O60359 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNG3O60359 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNG3O60359 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNG3O60359 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNG3O60359 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNG3O60359 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNG3O60359 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNG3O60359 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNG3O60359 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNG3O60359 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CACNG3O60359 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CACNG3O60359 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CACNG3O60359 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CACNG3O60359 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CACNG3O60359 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CACNG3O60359 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNG3O60359 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNG3O60359 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNG3O60359 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNG3O60359 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNG3O60359 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNG3O60359 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNG3O60359 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNG3O60359 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNG3O60359 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNG3O60359 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNG3O60359 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNG3O60359 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNG3O60359 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNG3O60359 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNG3O60359 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNG3O60359 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNG3O60359 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNG3O60359 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNG3O60359 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNG3O60359 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNG3O60359 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNG3O60359 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms