Protein–RNA interactions for Protein: O43791

SPOP, Speckle-type POZ protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOPO43791 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPOPO43791 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPOPO43791 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPOPO43791 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPOPO43791 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPOPO43791 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SPOPO43791 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPOPO43791 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPOPO43791 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPOPO43791 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPOPO43791 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPOPO43791 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPOPO43791 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPOPO43791 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPOPO43791 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPOPO43791 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPOPO43791 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPOPO43791 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPOPO43791 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPOPO43791 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPOPO43791 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPOPO43791 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPOPO43791 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPOPO43791 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPOPO43791 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPOPO43791 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPOPO43791 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPOPO43791 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPOPO43791 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SPOPO43791 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPOPO43791 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPOPO43791 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SPOPO43791 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPOPO43791 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPOPO43791 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPOPO43791 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPOPO43791 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPOPO43791 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPOPO43791 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPOPO43791 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPOPO43791 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPOPO43791 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPOPO43791 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPOPO43791 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SPOPO43791 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPOPO43791 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPOPO43791 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPOPO43791 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPOPO43791 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPOPO43791 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPOPO43791 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPOPO43791 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPOPO43791 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPOPO43791 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPOPO43791 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SPOPO43791 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPOPO43791 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPOPO43791 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPOPO43791 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPOPO43791 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPOPO43791 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPOPO43791 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SPOPO43791 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPOPO43791 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPOPO43791 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPOPO43791 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SPOPO43791 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPOPO43791 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPOPO43791 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPOPO43791 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPOPO43791 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPOPO43791 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPOPO43791 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPOPO43791 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPOPO43791 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPOPO43791 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPOPO43791 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPOPO43791 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPOPO43791 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPOPO43791 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPOPO43791 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPOPO43791 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPOPO43791 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPOPO43791 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPOPO43791 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPOPO43791 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPOPO43791 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPOPO43791 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPOPO43791 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPOPO43791 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPOPO43791 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SPOPO43791 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPOPO43791 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPOPO43791 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPOPO43791 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPOPO43791 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SPOPO43791 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPOPO43791 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPOPO43791 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPOPO43791 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms