Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYNGR2O43760 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYNGR2O43760 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYNGR2O43760 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYNGR2O43760 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYNGR2O43760 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYNGR2O43760 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYNGR2O43760 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYNGR2O43760 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYNGR2O43760 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYNGR2O43760 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYNGR2O43760 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYNGR2O43760 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYNGR2O43760 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYNGR2O43760 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SYNGR2O43760 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SYNGR2O43760 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYNGR2O43760 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYNGR2O43760 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYNGR2O43760 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYNGR2O43760 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYNGR2O43760 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYNGR2O43760 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYNGR2O43760 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYNGR2O43760 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYNGR2O43760 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SYNGR2O43760 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SYNGR2O43760 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYNGR2O43760 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYNGR2O43760 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYNGR2O43760 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYNGR2O43760 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYNGR2O43760 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYNGR2O43760 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SYNGR2O43760 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYNGR2O43760 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYNGR2O43760 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYNGR2O43760 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYNGR2O43760 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYNGR2O43760 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYNGR2O43760 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYNGR2O43760 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYNGR2O43760 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYNGR2O43760 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYNGR2O43760 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYNGR2O43760 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYNGR2O43760 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYNGR2O43760 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYNGR2O43760 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYNGR2O43760 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYNGR2O43760 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYNGR2O43760 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYNGR2O43760 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYNGR2O43760 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYNGR2O43760 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYNGR2O43760 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYNGR2O43760 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYNGR2O43760 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYNGR2O43760 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYNGR2O43760 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYNGR2O43760 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYNGR2O43760 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYNGR2O43760 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYNGR2O43760 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYNGR2O43760 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYNGR2O43760 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYNGR2O43760 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYNGR2O43760 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYNGR2O43760 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYNGR2O43760 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYNGR2O43760 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYNGR2O43760 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYNGR2O43760 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SYNGR2O43760 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYNGR2O43760 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYNGR2O43760 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYNGR2O43760 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYNGR2O43760 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYNGR2O43760 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYNGR2O43760 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SYNGR2O43760 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYNGR2O43760 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYNGR2O43760 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYNGR2O43760 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYNGR2O43760 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYNGR2O43760 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYNGR2O43760 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYNGR2O43760 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYNGR2O43760 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYNGR2O43760 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYNGR2O43760 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYNGR2O43760 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYNGR2O43760 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SYNGR2O43760 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYNGR2O43760 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYNGR2O43760 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYNGR2O43760 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYNGR2O43760 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYNGR2O43760 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYNGR2O43760 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms